中醫藥臨床實踐指南臨床問題構建中，即使干預要素（干預措施或對照措施）范圍界定合適，指南制訂者仍面臨繁多的干預種類需要進行優先性抉擇的瓶頸問題。本文通過分析干預措施優先性選擇的難點和必要性，提出將專家證據的方法擴展應用到干預措施優先性選擇過程中的思路，并進一步提供了專家證據數據收集表的設計、應用、數據收集呈現及最終專家決策方法的相關方法學建議，從而為指南制訂者提供參考和指導。
臨床實踐指南制訂中會納入不同的證據來源和證據類型，國內外對于多種來源證據體的研究和探索較少，本文倡導構建兼顧中醫藥特色的多源證據體，通過梳理70部指南指導手冊，分析多源證據體構建的必要性及優勢，并進一步從多源證據體的證據來源和證據邏輯角度進行理論闡釋和應用介紹，以期為中醫藥循證臨床實踐指南的制訂提供方法學參考。
目前臨床實踐指南制訂過程中，面臨臨床問題優先性選擇時，納入的是認可度高且變異性小即評分較高且專家間分歧較小的臨床問題，對于認可度高但變異性大的臨床問題予以排除，此方法容易使不同原因導致的變異性大但具有實際價值的臨床問題未被優先解決，存在一定的方法學和臨床局限性。本文通過總結臨床問題變異性在臨床經驗、實踐背景、價值觀方面產生的原因和內涵，分析變異性量化應用的優勢，并提出了相應的方法學處理建議，為指南制訂者在臨床問題優先性選擇時提供參考和指導。
目前國內外針灸相關臨床實踐指南的推薦意見中，針灸方案來源不透明，缺乏針灸方案合理性的綜合評價，且對于針灸方案選擇的標準不透明、不規范，撰寫及報告細節不足，導致指南的臨床適用性受到影響，一定程度上降低了指南推薦意見的使用率。本文從針灸方案的來源、合理性綜合評價、優先性選擇以及撰寫與報告幾個方面進行探討，并提出詳細的方法學建議，以期為指南制訂者提供臨床指南推薦意見的針灸方案評價、選擇和撰寫的方法學優化思路及建議。
臨床實踐指南推薦意見形成過程中，專家在進行最終決策時存在透明度不足、主觀性高的多個難點問題，如對維度的綜合考慮不全面、對維度之間的重要性評估存在較大異質性等。多準則決策分析作為一種決策工具，通過定性和定量相結合的方式來提升推薦意見形成的決策水平。本文通過介紹多準則決策對臨床指南推薦意見形成的決策輔助，并分析總結多準則決策的優勢及方法學建議，為指南制訂者解決推薦意見形成環節中的難點問題提供參考和指導。
中醫藥臨床實踐指南在制訂過程中常面臨證據缺乏的困境，指南制訂小組往往傾向于基于專家經驗或專家意見做出最終的決策，但是受到認知偏倚局限性的限制使得指南可信度和透明性降低。本文通過厘清專家經驗、專家意見與專家證據之間的區別，提出專家證據在中醫藥臨床實踐指南制訂中的學科優勢和必要性，并提供推薦意見形成環節使用專家證據的方法學設計和實施細節，保留中醫藥經驗性特色的同時一定程度上改善證據缺乏的困境，具有一定的實際應用價值。