隨著結核病防治研究的不斷深入, 人們發現細胞水平時代結核病流行病學的兩大問題———傳播途徑和傳染源, 是了解得不夠確切、不夠深刻的, 從傳染與發病的關系上鑒定外源性再感染, 用噬菌體分型毫無實際價值。而常規細菌培養法進行耐藥性監測作為流行病學調查方式之一, 只能了解其耐藥的表型狀況, 難以探討其內在機制。隨著分子生物學的飛速發展, 1980 年以后, 逐步建立了一些根據核酸序列進行菌株鑒定的高度特異的基因分型方法, 主要包括: 限制性片段長度多態性、DNA 指紋圖譜分析、脈沖場凝膠電泳、PCR酶切分型、隨機擴增多態性DNA、DNA 序列分析以及基因芯片技術等等。結合現代分子生物信息學技術, 使結核分枝桿菌的菌株分型進入了一個全新的領域———株水平的鑒定, 也進而使結核病分子流行病學的研究取得了很大的進展。許多研究者在結核病的流行病學研究中, 把群體研究與個體研究、宏觀研究與微觀研究結合起來, 研究結核分枝桿菌( Mycobacteriumtuberculosis,MTB) 的分子結構上的差異, 結合病例流行病學資料, 以闡明結核病的流行病學問題, 形成了結核病分子流行病學。分子分型技術是結核病分子流行病學研究的重要手段之一。對受感染個體的菌株進行分子分型在追蹤傳染源方面起重要作用。
目的 總結乳腺癌干細胞與基因分型的研究進展,并分析二者之間的相關性。方法 分析近年來有關乳腺癌干細胞與基因分型研究的文獻報道。結果 乳腺癌干細胞與基因分型的相關性研究支持了乳腺癌的腫瘤干細胞起源學說,解釋了乳腺癌基因分型的復雜性及其異質性。結論 乳腺癌干細胞和基因分型的相關性研究能為從細胞分子水平研究乳腺癌的形成機理和生物學特性找到新的途徑,有望為乳腺癌的診斷和治療提供新的策略與手段。
目的 對四川大學華西醫院的丙型肝炎患者 HCV 病毒基因分型特點進行分析，探討 HCV 主要基因型與臨床特征。 方法 納入 2011 年 3 月～2016 年 9 月就診于四川大學華西醫院 HCV 基因分型成功的 4 520 例 HCV 患者，對 HCV 基因型和主要基因型患者的肝功能、基線病毒載量進行分析，探討 HCV 基因型在肝癌、肝硬化和 HBV/HCV 復合感染患者的分布情況。 結果 納入患者的 HCV 基因型分為 1、2、3、4、6 五種基因型及 23 種亞型，基因型/亞型以 1b、1*、3b、2a、3a、6a 為主，分別占 66.42%、8.01%、6.57%、4.54%、4.29%、3.41%。男性和女性中均以 1b 型為主，分別占 29.89% 和 36.53%。HCV 主要基因型/亞型在門（急）診患者與住院患者中分布相似。HCV 主要基因型/亞型在不同年齡段均以 1b 型占優。在男性中，6a 亞型的 ALT 值最高；在女性中，3a 亞型的 ALT 值最高。納入的 94 例肝硬化患者中，1b 型最高 為42 例；6 例肝癌患者中，僅有 1b 和 3b 型檢出。HCV 和 HBV 雙重感染患者共 53 例，基因型3a占比最高，共 12 例。 結論 四川大學華西醫院就診 HCV 患者 HCV 基因型/亞型具有獨特的分布特點，以1b、1*、3b、2a、3a、6a 為主。
目的探討腫瘤壞死因子（TNF）-α 基因多態性與黑龍江省東部地區慢性阻塞性肺疾病（簡稱慢阻肺）人群易感性的相關性。方法選取 2016 年 1 月至 2017 年 1 月在佳木斯大學附屬第一醫院呼吸內科住院、門診確診的慢阻肺患者 347 例為病例組，同期本院體檢中心的健康體檢人群 338 例作為對照組。提取全血 DNA，通過高分辨熔解曲線突變檢測系統 HRM 及基因測序的方法檢測基因型，比較兩組基因表型及等位基因概率并進行 SHEsis 遺傳不平衡單倍型分析。結果TNF-α –308G/A 共顯性模型和隱性模型在兩組間差異有統計學意義（共顯性 P=0.036，OR 1.512，95%CI 1.023～2.234）；隱性 P=0.027，OR 1.202，95%CI 1.024～1.741）。–850G/A 共顯性模型、顯性模型和超顯性模型在兩組間差異均有統計學意義（共顯性 P=0.000，OR 1.781，95%CI 1.363～2.329；顯性 P=0.000，OR 0.391 7，95%CI 1.363～2.329；超顯性 P=0.000，OR 2.680，95%CI 1.728～4.156）］。單倍體分析及單倍體基因型分析結果顯示 +489、–308、–850 位點分別為 A、G、A 時有統計學意義（P<0.05，OR>1，95%CI>1）。病例組中按照肺功能分級相比較，–308G/A、–863C/A 位點突變基因組與野生型基因組肺功能差異有統計學意義（P=0.038，P=0.020）。結論在黑龍江省東部地區人群中，TNF-α –308 位點上 A、–850 位點上 G 等位基因可能是慢阻肺的危險因素，且純合子發病風險較高。當 +489、–308、–850 分別為 A、G、A 時可能是慢阻肺的危險因素，此三位點基因型為 AGA 的患者發病風險較高。TNF-α –308 中 A 等位基因、–863 中 A 等位基因與慢阻肺肺功能惡化有關，此二位點含 A 等位基因的慢阻肺患者肺功能下降速率更高、更易惡化。
目的探討四川大學華西醫院乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）基因型分布特征和耐藥突變情況，為乙型肝炎個體化治療提供依據。方法選擇 2016 年 1 月—2018 年 12 月于四川大學華西醫院就診的 786 例慢性乙型肝炎患者為研究對象，通過 Sanger 測序法測序并分析基因型和耐藥突變，應用 χ2 檢驗進行統計分析。結果786 例樣本中共檢出 B、C、D 3 種基因型，B 基因型 489 例（62.2%），C 基因型 291 例（37.0%），D 基因型 6 例（0.8%），B、C 基因型在不同年齡和民族中的分布差異有統計學意義（P<0.05）；627 例發生耐藥突變，耐藥突變率為 79.8%，對拉米夫定+替比夫定耐藥的病例數最多，有 262 例（33.3%），102 例（13.0%）對拉米夫定+替比夫定+恩替卡韋均耐藥，83 例（10.6%）對阿德福韋酯耐藥，該樣本群體中未發現替諾福韋耐藥株，B、C 基因型中不同藥物耐藥株之間的數量差異有統計學意義（χ2=14.356，P<0.01）；最常見的單點耐藥突變是 M204I，共 179 例（22.8%），其次是與阿德福韋酯耐藥相關的 A181V/T 有 46 例（5.9%）；混合耐藥突變最常見的是 L180M+M204V/I，共 83 例（10.6%），另檢出 102 例（13.0%）在 L180M+M204V/I 的基礎上出現了 M250V、V173L、T184A/G/S/I、S202G/I。結論四川大學華西醫院的 HBV 基因型以 B 型和 C 型為主，且耐藥形勢嚴峻，突變模式復雜，應及時檢測 HBV 基因型和耐藥突變，從而制定更好的臨床治療方案。
目的探討成人肝移植供受體 CYP3A5 基因分型與術后他克莫司藥物代謝的關系。方法回顧性收集天津市第一中心醫院 2018 年 7 月至 2019 年 6 月期間施行的肝移植的供受體各 98 例為研究對象，術前收集肝移植受體和供體血，通過 PCR 法檢測供受體的 CYP3A5 基因型，并收集術后 1、2、3 及 4 周的他克莫司濃度/劑量比。結果在 98 例肝移植供受體的 CYP3A5 基因分型中，均以 GG 型最多、AA 型最少，且等位基因分布符合遺傳規律，差異無統計學意義（P>0.05）。術后 1、2、3 及 4 周時，不管是在供體還是在受體中，3 種基因型組的他克莫司濃度/劑量比兩兩比較差異均有統計學意義（P<0.05），GG 型最高，AA 型最低。聯合供體和受體的基因型進行聯合分組分析，結果表明，術后 1、2、3 及 4 周時，A*/A*、A*/GG、GG/A* 和 GG/GG 組的他克莫司濃度/劑量比兩兩比較差異均有統計學意義（P<0.05），GG/GG 型最高，A*/A*型最低。結論供受體的 CYP3A5 基因分型可以影響受體肝移植術后他克莫司的血藥濃度，CYP3A5 GG 基因型比其他基因型更容易達到目標血藥濃度，檢測肝移植患者供受體 CYP3A5 基因型可以為受體肝移植術后他克莫司的個體化治療提供參考。
結核分枝桿菌是人類結核病的病原體。通過測定結核分枝桿菌基因分型，能及時發現結核病的疫情流行特點，分析不同轄區患者之間的傳播鏈條，從而及時制定有效的干預措施，為臨床的診斷和治療提供有力的依據。目前，結核分枝桿菌基因分型的幾種技術在應用上各有利弊，該文就結核分枝桿菌的基因分型技術、群體遺傳學和基因分型命名規則進行了綜述。