• 300384 天津醫科大學眼科醫院 天津醫科大學眼科研究所 天津醫科大學眼視光學院;
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目的觀察高糖狀態下視網膜血管內皮細胞基因表達譜的RNA-Seq分析結果。方法體外培養視網膜血管內皮細胞,取對數生長期細胞用于實驗。將細胞分為對照組、高糖組,兩組細胞分別采用5、25 mmol/L的葡萄糖持續培養48 h。應用RNA-Seq技術對兩組細胞進行全轉錄組測序,獲得生物學大數據,并在此基礎上分析差異表達基因;通過GO功能、Pathway顯著性富集分析對差異基因的功能及所在的信號通路進行解釋說明。結果對照組和高糖組之間共有449個差異表達基因。其中,上調基因297個,下調基因152個。差異基因功能涉及分子生物學過程調控以及細胞的能量代謝、蛋白合成等諸多方面,其中ITGB1BP2、NCF1、UNC5C等與炎癥的產生相關;AKR1C4、ATP1A3、CHST5、LCTL等與細胞的能量代謝相關;DAB1、PRSS55等與蛋白合成相關;SMAD9、BMP4等與細胞外基質的代謝相關。GO功能顯著性富集分析結果顯示,差異基因的功能主要可以劃分為生物學行為調控,細胞組分形成以及分子功能三大板塊,主要集中表現在生物學過程部分的系統形成和調節多細胞有機體的形成等。Pathway顯著性富集分析前20條具有明顯差異的通路,發現差異表達比較明顯的是轉化生長因子-β(TGF-β)信號通路、補體通路等,色氨酸、絲氨酸、氰氨酸等與氨基酸代謝相關的通路也受到了影響。其中,白細胞抑制因子9、骨形成蛋白4通過TGF-β信號通路發揮作用。結論高糖通過破壞視網膜血管內皮細胞的跨膜傳導、細胞外基質代謝以及蛋白質的轉錄和翻譯等,從而影響視網膜血管內皮細胞的功能。

引用本文: 張哲, 劉巨平, 東莉潔, 劉竹青, 黃亮瑜, 蘇睿虹, 趙今稚, 張曉敏, 李筱榮. 高糖狀態下視網膜血管內皮細胞基因表達譜的RNA-Seq分析. 中華眼底病雜志, 2018, 34(4): 377-381. doi: 10.3760/cma.j.issn.1005-1015.2018.04.014 復制

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