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      2. 華西醫學期刊出版社
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        找到 作者 包含"葛子路" 1條結果
        • 肩袖腱病環狀 RNA 表達特征與內源競爭 RNA 調控網絡構建的研究

          目的探究肩袖腱病中差異表達的環狀 RNA(circular RNA,circRNA)及其調控靶基因的預測和生物信息學分析。方法取 2018 年 6 月—2019 年 6 月因岡上肌腱損傷行手術治療的 10 例患者自愿捐贈肩袖組織,經 MRI、關節鏡檢查以及組織學染色,確定為正常肩袖或肩袖腱病組織,再依據患者年齡、體質量以及 Bonar 評分進行配對分組。通過高通量測序對肩袖組織進行 circRNA 檢測,篩選差異表達的 circRNA,對 circRNA 靶基因進行預測,并進行富集分析和內源競爭 RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)網絡構建。結果在 P<0.05、log2 差異表達倍數(fold change,FC)絕對值>2 條件下,共篩選出 94 條在正常肩袖及肩袖腱病組織中差異表達的 circRNA,其中肩袖腱病組織中有 31 條表達上調、63 條表達下調。基因本體(gene ontology,GO)分析發現差異基因最顯著富集于環磷酸腺苷應答;京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析發現,差異基因主要富集在細胞外基質-受體交互、蛋白消化及吸收、細胞循環、NF-κB 信號通路等。ceRNA 網絡揭示了差異表達的 circRNA 和 miRNA、mRNA 之間可能的相互作用,其中自由能最高的 ceRNA 調控軸為 circRNA.8951-has-miR-6089-DNMT3B。結論肩袖腱病中存在差異表達的 circRNA,可能與肩袖腱病發生發展密切相關,有望為臨床診斷、治療提供潛在靶點。

          發表時間:2020-06-15 02:43 導出 下載 收藏 掃碼
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