目的分析“雙軌合一”方式下臨床醫學專業學位碩士研究生在住院醫師規范化培養期間的論文發表情況。方法收集四川大學華西臨床醫學院2015～2017級在雙軌制方式下培養的634名專業學位研究生在培養學習和住培同時并行期間所發表論文數據，并對發表情況進行分析。結果634名臨床醫學專業學位碩士研究生在讀期間共發表論文1 038篇，三個年級人均發表論文1.606、1.554和1.785篇，總體人均發表論文1.637篇。發表文章的期刊類型構成比分別為：SCI，37.96%；MEDLINE，6.55%；核心期刊，55.49%。3個年級發表文章期刊類型有統計學差異。文章類型構成比分別為：個案報告，24.56%；綜述，34.01%；論著，41.43%。3個年級的文章構成比差異沒有統計學意義。結論臨床醫學專業碩士學位的研究生在“雙軌合一”方式下畢業前能達到發表相關論文的培養要求。