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      2. 華西醫學期刊出版社
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        找到 作者 包含"李建中" 2條結果
        • 基于綜合 DNA 序列特征的支持向量機方法識別核小體定位

          本文基于 Z 曲線(z-curve)理論和位置權重矩陣(PWM)提出一種構建核小體 DNA 序列的模型。該模型將核小體 DNA 序列集轉換成三維空間坐標,通過計算該序列集的位置權重矩陣獲得相似性權重得分,將兩者整合得到綜合序列特征模型(CSeqFM),并分別計算候選核小體序列和連接序列到模型 CSeqFM 的歐氏距離作為特征集,投入到支持向量機(SVM)中訓練和檢驗,通過十折交叉驗證進行性能評估。結果顯示,酵母核小體定位的敏感性、特異性、準確率和 Matthews 相關系數(MCC)分別為 97.1%、96.9%、94.2% 和 0.89,受試者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲線下面積(area under curve,AUC)達到 0.980 1。與其他相關 Z 曲線方法比較,CSeqFM 方法在各項評估指標中均表現出優勢,具有更好的識別效果。同時,將 CSeqFM 方法推廣到線蟲、人類和果蠅的核小體定位識別中,AUC 均高于 0.90,與 iNuc-STNC 和 iNuc-PseKNC 方法比較,CSeqFM 方法也表現出較好的穩定性和有效性,進一步表明該方法具有較好的可靠性和識別效能。

          發表時間:2020-08-21 07:07 導出 下載 收藏 掃碼
        • 紫紺及非紫紺型先心病患者來源的人骨髓間充質干細胞抗凋亡能力的比較

          目的對比紫紺型先心病(cyanotic congenital heart disease,C-CHD)和非紫紺型先心病(acyanotic congenital heart disease,A-CHD)患兒來源的骨髓間充質干細胞(human mesenchymal stem cells,hMSCs)在乏氧環境下的抗凋亡能力,并探討其發生機制。 方法hMSCs取自C-CHD(C組)和A-CHD(A組)患兒(男女不限,0~5歲),于體外乏氧環境下(1% O2,5% CO2,94% N2)培養。以Annexin Ⅴ/PI雙染結合流式細胞技術對比兩組細胞抵御缺血缺氧誘導細胞凋亡的能力;以Western blot法檢測兩組細胞中B細胞淋巴瘤-2基因(B-cell lymphoma-2,Bcl-2),Bcl-2相關X蛋白(Bax)以及半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(caspase-3)的含量。 結果Annexin Ⅴ/PI雙染結合流式細胞檢測結果顯示:在缺血缺氧環境下,C組細胞的早期凋亡率(P<0.01)和總體凋亡率(P<0.05)低于A組細胞。Western-blot檢測結果顯示:C組細胞的凋亡抑制基因Bcl-2的含量高于A組細胞(P<0.05),抗凋亡抑制基因Bax(P<0.05)以及caspase-3(P<0.05)的含量低于A組細胞。 結論C-CHD患者來源的hMSCs具有更好的抗缺血缺氧誘導的總凋亡及早期凋亡能力,這可能與其天然乏氧誘導的Bcl-2表達上調,Bax,caspase-3表達下調有關。

          發表時間:2016-12-06 05:27 導出 下載 收藏 掃碼
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