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      2. 華西醫學期刊出版社
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        找到 作者 包含"宋昊" 3條結果
        • 光感受器661細胞系早期低氧損傷轉錄組測序的生物信息學分析

          目的觀察661W細胞低氧條件下基因表達水平和信號通路的早期改變,尋找潛在功能性靶基因。方法將培養的小鼠661W細胞分為低氧處理組、常氧對照組。低氧處理組細胞置于37 ℃、體積分數分別為1%、5% CO2的三氣培養箱中培養;常氧對照組細胞置于37 ℃、體積分數為5% CO2培養箱中培養。培養4 h后,采用高通量測序技術對兩組661W細胞進行轉錄組測序,篩選顯著差異表達基因(DEG)。對篩選得到的DEG進行聚類熱圖分析、基因注釋(GO)功能富集分析、京都基因與基因組百科全書(KEGG)的信號通路富集分析和蛋白互作網絡(PPI)分析。采用逆轉錄聚合酶鏈反應(RT-PCR)對DEG mRNA表達進行驗證。結果共篩選出506個DEG,其中上調基因459個,下調基因47個。GO功能富集分析結果顯示,DEG主要富集的生物過程是細胞對低氧反應、糖酵解、細胞增生負調控及凋亡等。KEGG信號通路富集分析結果顯示,糖酵解與糖異生、果糖代謝、磷酸戊糖途徑以及淀粉和蔗糖代謝等糖代謝途徑被顯著富集。缺氧誘導因子(HIF)-1α信號通路、糖酵解、FoxO信號通路、胰島素信號通路和腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)信號通路參與了上述過程。PPI分析結果顯示,低氧相關的關鍵基因是Aldoa、Aldoc、Gpi1、Hk2、Hk1、Pfkl、Pfkp、Vhl、Fbxo10、Fbxo27。RT-PCR檢測結果顯示,低氧處理組細胞中15個DEG mRNA表達水平均較常氧對照組升高,差異有統計學意義(P<0.05)。N-myc下游調控基因-1(Ndrg1)、Mt1及血管內皮生長因子A(VEGFA) mRNA表達水平有低氧時間依賴性。結論低氧下DEG主要為糖代謝相關基因、細胞對缺氧反應相關基因以及調控增生和凋亡相關基因。HIF-1α信號通路、糖酵解、FoxO信號通路和AMPK信號通路參與了低氧下661W細胞的早期改變。Aldoa、Aldoc、Gpi1、Hk2、Hk1、Pfkl、Pfkp、Vhl、Fbxo10、Fbxo27可能在661W細胞應對低氧反應中起到關鍵作用。Ndrg1、Mt1及VEGFA可作為研究缺血、缺氧相關眼底疾病的潛在功能性靶基因。

          發表時間:2021-04-19 03:36 導出 下載 收藏 掃碼
        • 基于獨立成分分析的非侵入式腦-機接口眼電偽跡自動去除算法

          非侵入式腦-機接口已經逐步成為當前研究的熱點,在精神障礙檢測、生理監測等多方面都有所應用。但是非侵入式腦-機接口所需的腦電信號容易受到眼電偽跡污染,會嚴重影響對腦電信號的解碼分析。對此,本文提出了一種結合頻率濾波器的改進型獨立成分分析算法,以相關系數和峰度雙重閾值為依據自動識別偽跡組件;利用眼電與腦電頻率的差異,通過頻率濾波器去除偽跡組件中的眼電信息,從而保留更多腦電信息。在公開數據集和本實驗室數據上的實驗結果表明,本文算法可以有效提升眼電偽跡去除效果,同時改善腦電信息損失,這有助于非侵入式腦-機接口的推廣。

          發表時間: 導出 下載 收藏 掃碼
        • 病理性近視黃斑病變國際分類的一致性評估

          目的觀察不同臨床經驗眼科醫師對嚴重病理性近視(PM)黃斑病變國際分類的一致性。方法回顧性臨床研究。2019年1月至2021年12月于首都醫科大學附屬北京同仁醫院眼科中心檢查的嚴重PM黃斑病變患者102例171只眼納入研究。詳細收集患者年齡、性別以及眼軸長度、等效球鏡度、眼底彩色照相、光相干斷層掃描(OCT)檢查等臨床資料。從事PM診療與研究的6名不同臨床經驗醫師(A、B、C、D、E、F)分別獨立對患者彩色眼底像進行判讀并對嚴重PM黃斑病變進行PM薈萃分析(META-PM)分類和萎縮(atrophy)-牽拉(traction)-新生血管(neovascular)相關新型分類系統(ATN分類)中萎縮(A)分類進行分類;依據ATN分類中牽拉(T)分類標準,對OCT圖像進行判讀并分類,其中T0再細分為視網膜色素上皮(RPE)存在和脈絡膜薄變、脈絡膜新生血管伴部分RPE和脈絡膜萎縮、RPE和脈絡膜萎縮等3類。板層黃斑裂孔無法采用ATN分類標準進行分類,定義為TX。采用Kappa(κ)檢驗分析醫師A、B、C、D、E與F間分類結果的一致性。κ值≤0.4為一致性較低,0.4<κ值≤0.6為一致性中等,κ值>0.6為一致性較強。結果102例171只眼中,男性20例37只眼(19.6%,20/102),女性82例134只眼(80.4%,82/102);年齡(61.97±8.78)歲;眼軸長度(30.87±1.93)mm;等效球鏡度(-16.56±7.00)D。META-PM分類和ATN分類中萎縮(A)分類結果,醫師A、B、C、D、E與醫師F的一致性分別為73.01%、77.19%、81.28%、81.28%、88.89%;κ值分別為0.472、0.538、0.608、0.610、0.753。ATN分類中牽拉(T)分類T0、T1、T2、T3、T4、T5分別為109、18、11、12、9、8只眼;TX者4只眼。結論不同臨床經驗醫師對嚴重PM黃斑病變分類的一致性存在差異,隨臨床經驗的積累其一致性會逐漸提高。

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