目的了解獲得性免疫缺陷綜合征（AIDS）合并感染性葡萄膜炎患者眼內液病原微生物分布情況。方法回顧性病例研究。2018年6月至2019年12月于上海市公共衛生臨床中心住院或門診就診的AIDS合并感染性葡萄膜炎患者31例納入研究。其中，男性30例，女性1例；平均年齡（38.51±11.17）歲。全葡萄膜炎20例，后葡萄膜炎10例，感染性眼內炎1例。同期血清CD4+T淋巴細胞計數（CD4+TC）0～239個/μl。采用二代基因測序技術對采集的眼內液進行檢測。31份標本中，房水、玻璃體液分別為27、4份。結果31份標本中，檢測到巨細胞病毒（CMV）18份（58.1%，18/31）；水痘-帶狀皰疹病毒（VZV）5份（16.1%，5/31）；Epstein-Barr病毒（EBV）9份（29.0%，9/31）；人類β皰疹病毒6型（HHV6）3份（9.7%，3/31），人乳頭狀軟疣病毒（HPV）、人多瘤病毒、庚型肝炎病毒各1份（3.2%，1/31），均與其他微生物共存；細環病毒8份（25.8%，8/31）；梅毒螺旋體5份（16.1%，5/31）；剛地弓形蟲和哈蒙哈蒙球蟲1份（3.2%，1/31）；Synitelium Polycarpum 1份（3.2%，1/31）；結核分支桿菌復合群、真菌、微桿菌共存1份（3.2%，1/31）。CMV 18份標本中，基因序列數＞105 9份（50.0%），104～105 5份（27.7%）。VZV 5份標本中，基因序列數＞104 4份（80.0%）。結核分支桿菌復合群、真菌、微桿菌共存的1份標本，基因序列數均＜100。所有標本中讀取到的HHV6、HPV、人多瘤病毒、庚型炎病毒、細環病毒基因序列數均較低。31份標本中，檢測到病原微生物≥2種15份（48.4%）。結論CMV、VZV是血清CD4+TC＜100個/μl AIDS患者感染性葡萄膜炎的主要致病微生物；梅毒螺旋體、剛地弓形蟲或其他原蟲、結核桿菌、真菌引起的感染性葡萄膜炎更常見于血清CD4+TC＞100個/μl的AIDS患者。合并感染性葡萄膜炎的AIDS患者眼內液中可檢測到2種或以上微生物共存。