引用本文: 程弦, 白樹堂. CYP2C9 及 APOE 基因多態性與華法林穩態劑量和模型預測劑量的相關性研究. 中國胸心血管外科臨床雜志, 2019, 26(6): 543-547. doi: 10.7507/1007-4848.201810012 復制
臨床上,華法林可預防血栓的形成及發生,其口服需要依據國際標準化比值(INR)[1-2]。有研究表明,華法林使用劑量與個體間細胞色素 P450(cytochrome P450,CYP450)2C9(CYP2C9)和載脂蛋白(apolipoprotein E,APOE)基因多態性有關,即使在 INR 限值內口服,仍可能發生相關并發癥[3-5]。目前,心臟瓣膜置換術后臨床上常采用華法林進行抗凝治療。本文以 368 例心臟瓣膜置換術患者作為研究對象,探討中國海南地區人群 CYP2C9 和 APOE 對華法林穩態劑量的影響,現報道如下。
1 資料與方法
1.1 臨床資料
選取我院心胸外二科 2016 年 8 月至 2018 年 7 月收治的 368 例行心臟瓣膜置換術患者。入選標準:所有研究對象均符合歐洲心臟病學會(ESC)及我國以往超聲診斷心力衰竭標準對臨床慢性心力衰竭的診斷;男女不限,戶籍為海南省的 18 周歲以上患者;患者與患者間無血緣關系及異族通婚史;肝腎功能、血小板計數正常;因風濕性心臟病進行了人工心臟機械瓣膜置換術;飲食均衡穩定;已達到華法林穩態劑量。術后采用口服華法林抗凝治療;INR=2~3;所有患者及其家屬簽署知情同意。排除標準:長期抽煙或飲酒;合并腫瘤;卒中史;合并高血壓、糖尿病、心力衰竭、心肌病、冠狀動脈粥樣硬化性心臟病、甲狀腺功能亢進癥等疾病;同時服用阿司匹林、胺碘酮、甲狀腺素、增加 INR 藥物、降低 INR 藥物、他汀類藥物;同時服用中草藥;術前或術后有嚴重出血或栓塞史;孕婦或哺乳期患者。華法林穩態劑量即:采用華法林治療 7 d 以上時,至少連續 2 次(間隔至少 1~2 周)的 INR 處于 2~3 范圍。華法林的平均日劑量值=周劑量/7 d。本研究已獲得我院倫理委員會的批準[2016-(倫審)-84]。
1.2 試劑與儀器
試劑包括:2 × Taq Master Mixture(北京全式金生物科技有限公司,中國),DNA 分子質量 Marker(大連 TaKaRa 生物科技有限公司,中國),Tiagen 膠回收試劑盒(天根生化科技有限公司,德國),Quick Start DNA 測序試劑盒(ABI 公司,美國),全血 DNA 提取試劑盒(Qiagen 生物科技有限公司,德國),去磷酸酶 CIAP(生工生物公司,中國)和核酸外切酶 ExoⅠ(Promega 公司,美國)。PCR 擴增引物均在上海生工生物公司合成。儀器包括:電泳儀及水平電泳槽(六一儀器公司,中國),UV200 紫外分光光度儀(島津公司,日本),普通 PCR 儀(Eppendorf 公司,美國),凝膠成像系統(Thermo Fisher 生物科技有限公司,美國)和 CEQTM 8000 測序儀(Beckman Coulter 公司,美國)。
1.3 全血樣本收集
所有患者均采靜脈血 3 ml,離心、儲存、備用。同時記錄患者的一般臨床資料,如 INR 值、計算機模型預測劑量、華法林穩態劑量等。
1.4 DNA 提取
首先,對每個受試者采取外周靜脈血 2.0 ml 于乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝管中,置于–80℃ 冰箱內保存備用。其次,采用 Qiagen 基因組 DNA 提取試劑盒,提取患者血樣 DNA,冰箱保存、備用。單核苷酸多態性(SNP)位點選擇:CYP2C9*3 (等位基因突變位點:1075A>C,基因在染色體位置:10q24.1,SNP 檢索序列號:rs1057910);APOE 基因位于第 19 號染色體長臂 13 區 2 帶(19p13.2),共有 3 種主要的亞型 E2、E3、E4,其相應的編碼基因分別為 e2、e3、e4,根據患者基因型將其分為三組,依次是 E2 組(E2/E2,E2/E3),E3 組(E3/E3)和 E4 組(E4/E4,E3/E4)。
1.5 PCR 擴增目的片段
采用 20 μl PCR 反應體系,主要組分如下:2×Taq Master Mixture(其中含有 2.5 mM dNTP,PCR 反應緩沖液以及高保真的 DNA 聚合酶)10 μl,加入的基因組 DNA 含量為 50~100 ng,并加入終濃度為 0.2 μmol/L 上下游引物,最后用 ddH2O 將反應體系補加至 20 μl,混勻之后放入 PCR 儀器進行反應。PCR 擴增反應的條件設置如下:預變性:94℃ 2 min;擴增(35 個循環):94℃ 變性 25 s,58℃ 退火 30 s,70℃ 延伸 30 s;再延伸:70℃ 延伸 5 min。通過以上 PCR 擴增反應,將從基因組 DNA 中特異性擴增 257 bp 包含有 APOE 基因第 112、158 位密碼子的 DNA 片段,和 383 bp 包含有 CYP2C9 基因第 7 外顯子的 DNA 片段,并對擴增產物用 1%~2% 瓊脂糖凝膠電泳進行初步鑒定,PCR 擴增引物見表 1。

1.6 DNA 產物的測序分析
PCR 擴增完成鑒定正確后,從中取出 5 μl PCR 產物進行核酸消化和牛小腸堿性磷酸酶(CIAP)去磷酸化處理,采用 10 μl 反應體系,加入 4 U 堿性磷酸酶 CIAP,1.5 U 核酸外切酶 ExoⅠ混合均勻,37℃ 孵育 30 min 進行反應,之后采用 85℃ 加熱 10 min 對酶蛋白進行失活處理;從 10 μl 反應體系中,回收去磷酸化的核苷產物,利用美國 Beckman Coulter 公司的 CEQ8000 自動序列測序儀對 PCR 產物進行核苷酸序列的測定,測序結果可經 lasergen 7 和 Chromas 軟件進行查看和分析。
1.7 統計學分析
計量資料采用均數±標準差()表示,而計數資料則用例數和百分比表示,所有數據用 SPSS21.0 統計軟件進行統計學分析。計量資料在進行分析前,先行正態性分布的檢驗,如若數據不服從正態分布,則對數據進行適當的變化,比如自然對數轉換,對轉換后的資料再進行正態性檢驗,如若仍不符合正態分布,則對該資料采用非參數的分析檢驗。SNP 的基因型以及等位基因的頻率直接采用計數法進行統計分析,資料比較采用 χ2 檢驗,以確定其基因分布是否符合 Hardy-Weinberg 遺傳定律。以華法林穩態劑量為因變量,對自變量進行逐步多元回歸,嘗試建立不同個體間關于華法林穩態劑量預測模型。
2 結果
2.1 患者基礎資料分析
本研究對象的基礎資料見表 2,通過對研究人群中 CYP2C9 基因和 APOE 基因的基因型頻率進行 χ2 檢驗,發現其分布符合 Hardy-Weillberg 遺傳平衡定律。其中,在本研究 368 例海南患者中,其華法林穩態劑量范圍在 0. 86~9. 47 mg/d 之間,平均劑量則為(3.45±0.87)mg/d。


2.2 不同基因型患者華法林穩態劑量比較
在 368 例海南患者中,CYP2C9*1*1 基因型患者 301 例,華法林平均穩態劑量為(3.47±0.94)mg/d;CYP2C9*1*3 基因型患者 67 例,華法林平均穩態劑量為(2.12±0.78)mg/d,顯著低于 CYP2C9*1*1 基因型患者,差異有統計學意義(P<0.05);APOE E2 基因型患者 93 例,華法林平均穩態劑量為(3.21±0.83)mg/d;APOE E3 基因型患者 221 例,華法林平均穩態劑量為(4.04±1.25)mg/d,相比于 APOE E2 基因型患者,顯著升高,差異有統計學意義(P<0.05);APOE E4 基因型患者 54 例,華法林平均穩態劑量為(4.59±1.43)mg/d,相比于 APOE E2 基因型患者,其華法林穩態劑量顯著升高,差異有統計學意義(P<0.05);見表 3。


2.3 華法林穩態劑量的影響因素分析
以患者的性別、年齡、身高、體重、有無吸煙史、有無飲酒史、CYP2C9 和 APOE 基因型為自變量,以華法林穩態劑量為因變量 Y,進行多元線性逐步回歸分析,結果顯示華法林劑量與患者的年齡、體重及 CYP2C9 與 APOE 基因型有關,回歸方程為:ln(Y)=1.430?0.047×年齡+0.213×體重-0.348×CYP2C9(*1*3)+0.816×APOE(E3)+0.943×APOE(E4),患者的體重、APOE 多態性與華法林穩態劑量正相關,而患者的年齡以及 CYP2C9*1*3 基因型則與華法林穩態劑量負相關;方程的調整 R2 為 0.572,表明該模型可解釋約 57.2% 接受華法林治療的心房顫動(房顫)患者中劑量的個體化差異;見表 4。

3 討論
臨床常用華法林抗凝治療瓣膜病合并房顫、瓣膜置換術后房顫等[6]。但其劑量在不同種族間及個體間存在較大差異[7-8]。另外,遺傳因素可解釋約 40%~80% 的個體劑量差異[9]。
CYP2C9 是 CYP2 家族中的一種同功酶,其基因多態性會影響代謝酶活性[10]。Higashi 等[11]發現華法林治療攜帶 CYP2C9*3 等位基因型的患者,其更易發生出血并發癥。APOE 基因是血漿的中的載脂蛋白之一,其通過維生素 K 的循環途徑來影響華法林抗凝劑量[12]。Kohnke 等[13]發現華法林治療攜帶一個 e4 等位基因的患者所需的治療劑量為 34.3 mg/d;而治療不攜帶 e4 等位基因者所需治療劑量則略低。Kimmel 等[14]發現華法林治療攜有 e4 等位基因患者所需劑量增加了 28.6%。黃盛文等[15]發現 APOE 基因型患者華法林劑量差異無統計學意義(P>0.05)。
本研究中 CYP2C9*1*1 基因型患者 301 例,占比 81.8%,*1*3 型患者 67 例,占比 18.2%,不同 CYP2C9 基因型患者,華法林穩態劑量差異有統計學意義(P<0.05);APOE E2 基因型患者 93 例,占比 25.3%,E3 基因型患者 221 例,占比 60.1%,E4 基因型患者 54 例,占比 14.7%,不同 APOE 基因型患者,華法林穩態劑量差異有統計學意義(P<0.05),表明在海南地區人群中,存在 CYP2C9 和 APOE 基因多態性。多因素逐步回歸分析發現 CYP2C9*1*3 基因型患者相比 CYP2C9*1*1 基因型患者華法林需求量較低;而 APOE E3、E4 基因型患者對華法林的需求量相比于 AOPE E2 基因型患者較高。
本研究發現,華法林劑量與患者的年齡、身高、體重及不同的基因型均有關,我們采用的預測模型中納入了遺傳因素以及臨床因素,能夠一定程度上估計華法林的準確用量。本研究回歸分析表明,該預測模型的調整 R2為 0.572。表明該模型可預測海南地區人群華法林劑量,減少華法林治療過程中過量的風險,并可使華法林達到穩定治療的時間縮短。
綜上所述,在我國海南地區人群不同基因型患者華法林穩態劑量存在一定差異。通過 CYP2C9、APOE 基因以及患者年齡、體重構建華法林穩態劑量預測模型,可以一定程度上解釋不同患者之間華法林用藥的差異。
臨床上,華法林可預防血栓的形成及發生,其口服需要依據國際標準化比值(INR)[1-2]。有研究表明,華法林使用劑量與個體間細胞色素 P450(cytochrome P450,CYP450)2C9(CYP2C9)和載脂蛋白(apolipoprotein E,APOE)基因多態性有關,即使在 INR 限值內口服,仍可能發生相關并發癥[3-5]。目前,心臟瓣膜置換術后臨床上常采用華法林進行抗凝治療。本文以 368 例心臟瓣膜置換術患者作為研究對象,探討中國海南地區人群 CYP2C9 和 APOE 對華法林穩態劑量的影響,現報道如下。
1 資料與方法
1.1 臨床資料
選取我院心胸外二科 2016 年 8 月至 2018 年 7 月收治的 368 例行心臟瓣膜置換術患者。入選標準:所有研究對象均符合歐洲心臟病學會(ESC)及我國以往超聲診斷心力衰竭標準對臨床慢性心力衰竭的診斷;男女不限,戶籍為海南省的 18 周歲以上患者;患者與患者間無血緣關系及異族通婚史;肝腎功能、血小板計數正常;因風濕性心臟病進行了人工心臟機械瓣膜置換術;飲食均衡穩定;已達到華法林穩態劑量。術后采用口服華法林抗凝治療;INR=2~3;所有患者及其家屬簽署知情同意。排除標準:長期抽煙或飲酒;合并腫瘤;卒中史;合并高血壓、糖尿病、心力衰竭、心肌病、冠狀動脈粥樣硬化性心臟病、甲狀腺功能亢進癥等疾病;同時服用阿司匹林、胺碘酮、甲狀腺素、增加 INR 藥物、降低 INR 藥物、他汀類藥物;同時服用中草藥;術前或術后有嚴重出血或栓塞史;孕婦或哺乳期患者。華法林穩態劑量即:采用華法林治療 7 d 以上時,至少連續 2 次(間隔至少 1~2 周)的 INR 處于 2~3 范圍。華法林的平均日劑量值=周劑量/7 d。本研究已獲得我院倫理委員會的批準[2016-(倫審)-84]。
1.2 試劑與儀器
試劑包括:2 × Taq Master Mixture(北京全式金生物科技有限公司,中國),DNA 分子質量 Marker(大連 TaKaRa 生物科技有限公司,中國),Tiagen 膠回收試劑盒(天根生化科技有限公司,德國),Quick Start DNA 測序試劑盒(ABI 公司,美國),全血 DNA 提取試劑盒(Qiagen 生物科技有限公司,德國),去磷酸酶 CIAP(生工生物公司,中國)和核酸外切酶 ExoⅠ(Promega 公司,美國)。PCR 擴增引物均在上海生工生物公司合成。儀器包括:電泳儀及水平電泳槽(六一儀器公司,中國),UV200 紫外分光光度儀(島津公司,日本),普通 PCR 儀(Eppendorf 公司,美國),凝膠成像系統(Thermo Fisher 生物科技有限公司,美國)和 CEQTM 8000 測序儀(Beckman Coulter 公司,美國)。
1.3 全血樣本收集
所有患者均采靜脈血 3 ml,離心、儲存、備用。同時記錄患者的一般臨床資料,如 INR 值、計算機模型預測劑量、華法林穩態劑量等。
1.4 DNA 提取
首先,對每個受試者采取外周靜脈血 2.0 ml 于乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝管中,置于–80℃ 冰箱內保存備用。其次,采用 Qiagen 基因組 DNA 提取試劑盒,提取患者血樣 DNA,冰箱保存、備用。單核苷酸多態性(SNP)位點選擇:CYP2C9*3 (等位基因突變位點:1075A>C,基因在染色體位置:10q24.1,SNP 檢索序列號:rs1057910);APOE 基因位于第 19 號染色體長臂 13 區 2 帶(19p13.2),共有 3 種主要的亞型 E2、E3、E4,其相應的編碼基因分別為 e2、e3、e4,根據患者基因型將其分為三組,依次是 E2 組(E2/E2,E2/E3),E3 組(E3/E3)和 E4 組(E4/E4,E3/E4)。
1.5 PCR 擴增目的片段
采用 20 μl PCR 反應體系,主要組分如下:2×Taq Master Mixture(其中含有 2.5 mM dNTP,PCR 反應緩沖液以及高保真的 DNA 聚合酶)10 μl,加入的基因組 DNA 含量為 50~100 ng,并加入終濃度為 0.2 μmol/L 上下游引物,最后用 ddH2O 將反應體系補加至 20 μl,混勻之后放入 PCR 儀器進行反應。PCR 擴增反應的條件設置如下:預變性:94℃ 2 min;擴增(35 個循環):94℃ 變性 25 s,58℃ 退火 30 s,70℃ 延伸 30 s;再延伸:70℃ 延伸 5 min。通過以上 PCR 擴增反應,將從基因組 DNA 中特異性擴增 257 bp 包含有 APOE 基因第 112、158 位密碼子的 DNA 片段,和 383 bp 包含有 CYP2C9 基因第 7 外顯子的 DNA 片段,并對擴增產物用 1%~2% 瓊脂糖凝膠電泳進行初步鑒定,PCR 擴增引物見表 1。

1.6 DNA 產物的測序分析
PCR 擴增完成鑒定正確后,從中取出 5 μl PCR 產物進行核酸消化和牛小腸堿性磷酸酶(CIAP)去磷酸化處理,采用 10 μl 反應體系,加入 4 U 堿性磷酸酶 CIAP,1.5 U 核酸外切酶 ExoⅠ混合均勻,37℃ 孵育 30 min 進行反應,之后采用 85℃ 加熱 10 min 對酶蛋白進行失活處理;從 10 μl 反應體系中,回收去磷酸化的核苷產物,利用美國 Beckman Coulter 公司的 CEQ8000 自動序列測序儀對 PCR 產物進行核苷酸序列的測定,測序結果可經 lasergen 7 和 Chromas 軟件進行查看和分析。
1.7 統計學分析
計量資料采用均數±標準差()表示,而計數資料則用例數和百分比表示,所有數據用 SPSS21.0 統計軟件進行統計學分析。計量資料在進行分析前,先行正態性分布的檢驗,如若數據不服從正態分布,則對數據進行適當的變化,比如自然對數轉換,對轉換后的資料再進行正態性檢驗,如若仍不符合正態分布,則對該資料采用非參數的分析檢驗。SNP 的基因型以及等位基因的頻率直接采用計數法進行統計分析,資料比較采用 χ2 檢驗,以確定其基因分布是否符合 Hardy-Weinberg 遺傳定律。以華法林穩態劑量為因變量,對自變量進行逐步多元回歸,嘗試建立不同個體間關于華法林穩態劑量預測模型。
2 結果
2.1 患者基礎資料分析
本研究對象的基礎資料見表 2,通過對研究人群中 CYP2C9 基因和 APOE 基因的基因型頻率進行 χ2 檢驗,發現其分布符合 Hardy-Weillberg 遺傳平衡定律。其中,在本研究 368 例海南患者中,其華法林穩態劑量范圍在 0. 86~9. 47 mg/d 之間,平均劑量則為(3.45±0.87)mg/d。


2.2 不同基因型患者華法林穩態劑量比較
在 368 例海南患者中,CYP2C9*1*1 基因型患者 301 例,華法林平均穩態劑量為(3.47±0.94)mg/d;CYP2C9*1*3 基因型患者 67 例,華法林平均穩態劑量為(2.12±0.78)mg/d,顯著低于 CYP2C9*1*1 基因型患者,差異有統計學意義(P<0.05);APOE E2 基因型患者 93 例,華法林平均穩態劑量為(3.21±0.83)mg/d;APOE E3 基因型患者 221 例,華法林平均穩態劑量為(4.04±1.25)mg/d,相比于 APOE E2 基因型患者,顯著升高,差異有統計學意義(P<0.05);APOE E4 基因型患者 54 例,華法林平均穩態劑量為(4.59±1.43)mg/d,相比于 APOE E2 基因型患者,其華法林穩態劑量顯著升高,差異有統計學意義(P<0.05);見表 3。


2.3 華法林穩態劑量的影響因素分析
以患者的性別、年齡、身高、體重、有無吸煙史、有無飲酒史、CYP2C9 和 APOE 基因型為自變量,以華法林穩態劑量為因變量 Y,進行多元線性逐步回歸分析,結果顯示華法林劑量與患者的年齡、體重及 CYP2C9 與 APOE 基因型有關,回歸方程為:ln(Y)=1.430?0.047×年齡+0.213×體重-0.348×CYP2C9(*1*3)+0.816×APOE(E3)+0.943×APOE(E4),患者的體重、APOE 多態性與華法林穩態劑量正相關,而患者的年齡以及 CYP2C9*1*3 基因型則與華法林穩態劑量負相關;方程的調整 R2 為 0.572,表明該模型可解釋約 57.2% 接受華法林治療的心房顫動(房顫)患者中劑量的個體化差異;見表 4。

3 討論
臨床常用華法林抗凝治療瓣膜病合并房顫、瓣膜置換術后房顫等[6]。但其劑量在不同種族間及個體間存在較大差異[7-8]。另外,遺傳因素可解釋約 40%~80% 的個體劑量差異[9]。
CYP2C9 是 CYP2 家族中的一種同功酶,其基因多態性會影響代謝酶活性[10]。Higashi 等[11]發現華法林治療攜帶 CYP2C9*3 等位基因型的患者,其更易發生出血并發癥。APOE 基因是血漿的中的載脂蛋白之一,其通過維生素 K 的循環途徑來影響華法林抗凝劑量[12]。Kohnke 等[13]發現華法林治療攜帶一個 e4 等位基因的患者所需的治療劑量為 34.3 mg/d;而治療不攜帶 e4 等位基因者所需治療劑量則略低。Kimmel 等[14]發現華法林治療攜有 e4 等位基因患者所需劑量增加了 28.6%。黃盛文等[15]發現 APOE 基因型患者華法林劑量差異無統計學意義(P>0.05)。
本研究中 CYP2C9*1*1 基因型患者 301 例,占比 81.8%,*1*3 型患者 67 例,占比 18.2%,不同 CYP2C9 基因型患者,華法林穩態劑量差異有統計學意義(P<0.05);APOE E2 基因型患者 93 例,占比 25.3%,E3 基因型患者 221 例,占比 60.1%,E4 基因型患者 54 例,占比 14.7%,不同 APOE 基因型患者,華法林穩態劑量差異有統計學意義(P<0.05),表明在海南地區人群中,存在 CYP2C9 和 APOE 基因多態性。多因素逐步回歸分析發現 CYP2C9*1*3 基因型患者相比 CYP2C9*1*1 基因型患者華法林需求量較低;而 APOE E3、E4 基因型患者對華法林的需求量相比于 AOPE E2 基因型患者較高。
本研究發現,華法林劑量與患者的年齡、身高、體重及不同的基因型均有關,我們采用的預測模型中納入了遺傳因素以及臨床因素,能夠一定程度上估計華法林的準確用量。本研究回歸分析表明,該預測模型的調整 R2為 0.572。表明該模型可預測海南地區人群華法林劑量,減少華法林治療過程中過量的風險,并可使華法林達到穩定治療的時間縮短。
綜上所述,在我國海南地區人群不同基因型患者華法林穩態劑量存在一定差異。通過 CYP2C9、APOE 基因以及患者年齡、體重構建華法林穩態劑量預測模型,可以一定程度上解釋不同患者之間華法林用藥的差異。