• 1. 黑龍江中醫藥大學第一臨床醫學院(哈爾濱 150040);
  • 2. 哈爾濱市道里區人民醫院婦科(哈爾濱 150040);
  • 3. 黑龍江中醫藥大學附屬第二醫院國醫堂(哈爾濱 150040);
  • 4. 黑龍江中醫藥大學附屬第一醫院婦一科(哈爾濱 ?150040);
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目的  利用生物信息學探討多囊卵巢綜合征中環狀 RNA(circular RNA,circRNA)的差異表達,并預測與之相結合的微 RNA(microRNA,miRNA)。方法  通過基因表達綜合數據庫查找多囊卵巢綜合征的卵丘細胞基因芯片表達譜,采用數據庫自帶的 GEO2R 工具篩選出差異 circRNA,并利用 DAVID 6.8 數據庫對差異 circRNA 基因進行基因本體分析及京都基因和基因組數據庫信號通路分析,使用 Circular RNA interactome 預測潛在調控的 miRNA,并利用 Cytoscape 軟件建立 circRNA-miRNA 網絡圖,預測差異最顯著的上調和下調的 circRNA 潛在調控的 miRNA 各 5 個。結果  共獲得多囊卵巢綜合征差異 circRNA 247 個,預測到與上調 circRNA 基因結合的 miRNA 共 277 個,與下調 circRNA 基因結合的 miRNA 共 125 個,前 10 個能夠與多個差異 circRNA 結合的 miRNA 分別為 hsa-miR-557、hsa-miR-507、hsa-miR-224、hsa-miR-136、hsa-miR-127-5p、hsa-miR-579、hsa-miR-502-5p、hsa-miR-186、hsa-miR-1253、hsa-miR-432。結論  circRNA 的差異表達分析有利于了解 circRNA 在多囊卵巢綜合征中發揮的主要作用,分析預測潛在調控的 miRNA 能幫助了解該病的相關發病機制。

引用本文: 吳登輝, 于津瀾, 張蛟, 楊麗珍, 孫玉華, 張躍輝. 多囊卵巢綜合征中環狀 RNA 差異表達的生物信息學分析. 華西醫學, 2022, 37(2): 231-236. doi: 10.7507/1002-0179.202012054 復制

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