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      2. 華西醫學期刊出版社
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        找到 作者 包含"郝博" 1條結果
        • 基于GEO數據庫與生物信息學方法分析食管鱗狀細胞癌中的免疫微環境和潛在敏感藥物

          目的構建基于免疫檢查點相關基因的食管鱗狀細胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)預后模型,并探索這些基因與腫瘤微環境(tumor microenvironment,TME)的潛在關聯。方法收集基因表達綜合數據庫(GEO)GSE53625 數據集中ESCC樣本及其癌旁組織樣本的免疫檢查點基因轉錄組測序數據和臨床資料。評估ESCC和正常癌旁組織中免疫檢查點基因表達差異,對在食管癌中的高表達差異基因進行藥物敏感性分析。對生存相關的基因構建風險模型并研究不同風險組不同亞型預后特征、通路富集、免疫檢查點、免疫評分、免疫細胞浸潤及其潛在敏感藥物。結果共收集358個樣本(來自179例患者的ESCC樣本及其癌旁組織樣本),其中男33例、女146例,≤60 歲80例,>60歲99例。共39個免疫檢查點基因在ESCC組織中差異表達,包括14個低表達基因和25個高表達基因。針對其中8個顯著高表達基因(TNFRSF8、CTLA4、TNFRSF4、CD276、TNFSF4、IDO1、CD80、TNFRSF18)進行藥物敏感性分析,發現多種化合物對這些免疫治療靶點敏感。通過最小絕對收縮和選擇算子回歸分析構建基于3個預后相關基因(NRP1、ICOSLG、HHLA2)的風險模型,發現高風險組的總生存期顯著短于低風險組(P<0.001),分析不同ESCC亞型也得出類似結果,并且基于免疫檢查點基因的風險評分被確定為ESCC的獨立預后指標。不同風險組具有獨特的通路富集、免疫細胞浸潤、TME和藥物敏感性。結論本研究建立了一個基于免疫檢查點基因的預后模型,能夠準確對ESCC進行分層,并對不同風險的ESCC患者提供了潛在的敏感藥物,為ESCC個性化治療提供了一種可能。

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