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利用 TCGA 數據庫構建男性乳腺癌的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA 網絡

目的通過構建男性乳腺癌的競爭性內源 RNA（ceRNA）調控網絡，探討其發病機制。方法從 TCGA 數據庫（The Cancer Genome Atlas Database）中下載男性乳腺癌的長鏈非編碼 RNA（lncRNA）、微小 RNA（miRNA）和 mRNA 的表達譜數據，通過 R 軟件的 limma 數據包分析男性乳腺癌差異表達的 lncRNA、miRNA 和 mRNA；分析三者之間的靶向調控關系，構建 ceRNA 網絡，并用 Cytoscape 軟件可視化，并將差異表達基因進行 GO 富集和 KEGG 通路分析。結果男性乳腺癌中差異表達的 lncRNA 為 275 種，差異表達的 miRNA 為 33 種，差異表達的 mRNA 為 1 675 種。本研究成功構建了男性乳腺癌的 lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA 網絡后，GO 富集分析顯示，差異表達 mRNA 參與細胞增殖的負調控、轉錄的負調控、細胞蛋白質代謝過程的調控、細胞遷移的調控、轉移酶活性的正調控、間充質細胞增殖的正調控等。KEGG 通路分析顯示，差異表達 mRNA 參與癌癥的途徑、白細胞跨內皮遷移、絲裂原活化蛋白激酶（MAPK）和神經營養蛋白信號通路。結論本研究基于 TCGA 數據庫成功構建了男性乳腺癌的 ceRNA 網絡。