本研究旨在從國家衛生健康委員會發布的《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第九版)》重型和危重型藥方中篩選可能對新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)有治療作用的活性成分,并通過其與嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒2(SARS-CoV-2)蛋白的相互作用闡釋其作用機制。采用國際ETCM數據庫和SwissADME數據庫篩選3個藥方中25味中藥所含有的活性成分,使用PDB數據庫獲取SARS-CoV-2的4種蛋白質的晶體結構,采用Autodock Vina進行分子對接,使用GROMACS進行分子動力學模擬。分子結合能結果顯示夏姆比奧納、甘草素L、木犀草苷和黃芩苷等44種活性成分與SARS-CoV-2的多個靶點顯示出良好的結合親和力,而分子動力學模擬分析顯示夏姆比奧納與SARS-CoV-2的核衣殼蛋白能夠更緊密地結合并發揮有效的抑制作用。本研究采用現代技術方法對中藥活性成分進行研究,發現夏姆比奧納是SARS-CoV-2核衣殼蛋白的有效抑制劑,為開發新型的抗SARS-CoV-2藥物及其治療方法提供科學的理論依據。