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      2. 華西醫學期刊出版社
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        找到 作者 包含"梁海霞" 1條結果
        • 基于加權基因共表達網絡分析和機器學習的瘢痕疙瘩列線圖預測模型

          瘢痕疙瘩為傷口皮膚結締組織過度增生引起的良性皮膚腫瘤。精準預測創傷者瘢痕疙瘩患病風險并及時做出早期診斷,對深度管理瘢痕疙瘩和控制其發展具有重大意義。本研究對高通量基因表達綜合(GEO)數據庫中的4個瘢痕疙瘩數據集進行分析,篩選出瘢痕疙瘩的診斷標志物,并建立列線圖預測模型。首先,通過加權基因共表達網絡分析(WGCNA)、差異表達分析和蛋白質互作網絡中心性算法,篩選出37個核心蛋白質編碼基因。隨后,利用最小絕對值收斂和選擇算子(LASSO)以及支持向量機?遞歸特征消除(SVM-RFE)兩種機器學習算法,從中篩選出4個最具預測能力的瘢痕疙瘩診斷標志物,分別為肝細胞生長因子(HGF)、多配體蛋白聚糖4(SDC4)、外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶2(ENPP2)和Rho家族三磷酸鳥苷酶3(RND3),并通過單基因的基因集富集分析(GSEA)探索可能涉及的生物途徑。最后,對診斷標志物進行單因素與多因素邏輯回歸分析,并構建列線圖預測模型。經內外部驗證發現,該模型校準曲線貼近理想曲線,決策曲線優于其他策略,接受者操作特征曲線下面積高于對照模型(最佳截斷值為0.588),表明該模型具有較高的校準度、臨床收益率以及預測能力,有望為臨床診斷提供有效先期手段。

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