本文基于 Z 曲線（z-curve）理論和位置權重矩陣（PWM）提出一種構建核小體 DNA 序列的模型。該模型將核小體 DNA 序列集轉換成三維空間坐標，通過計算該序列集的位置權重矩陣獲得相似性權重得分，將兩者整合得到綜合序列特征模型（CSeqFM），并分別計算候選核小體序列和連接序列到模型 CSeqFM 的歐氏距離作為特征集，投入到支持向量機（SVM）中訓練和檢驗，通過十折交叉驗證進行性能評估。結果顯示，酵母核小體定位的敏感性、特異性、準確率和 Matthews 相關系數（MCC）分別為 97.1%、96.9%、94.2% 和 0.89，受試者操作特征（receiver operating characteristic，ROC）曲線下面積（area under curve，AUC）達到 0.980 1。與其他相關 Z 曲線方法比較，CSeqFM 方法在各項評估指標中均表現出優勢，具有更好的識別效果。同時，將 CSeqFM 方法推廣到線蟲、人類和果蠅的核小體定位識別中，AUC 均高于 0.90，與 iNuc-STNC 和 iNuc-PseKNC 方法比較，CSeqFM 方法也表現出較好的穩定性和有效性，進一步表明該方法具有較好的可靠性和識別效能。