針對二維電泳凝膠圖像匹配過程中,由于圖像局部非線性形變導致的偽匹配和漏匹配問題,本文提出了一種結合灰度分層和幾何分塊的自動匹配算法。首先,依據灰度和幾何位置對蛋白質點進行分組,采用形狀上下文特征,結合歸一化互相關法對蛋白質點進行粗匹配;然后,以粗匹配結果作為標記特征點,采用幾何相似性準則,對未匹配點進行精確匹配;最后,采用局部仿射變換模型,驗證匹配的正確性,去除偽匹配和漏匹配。通過對不同來源的凝膠圖像進行匹配實驗,結果表明本算法能有效解決蛋白質點匹配中的偽匹配和漏匹配問題,可獲得更為精確的匹配結果。