目的 探討采用熒光定量聚合酶鏈反應（FQ-PCR）檢測法診斷新生兒乙型肝炎病毒（HBV）感染的經濟學成本。 方法 對2010年3月－2010年7月間202例日齡在28 d以內的新生兒采用酶聯免疫吸附法檢測HBV血清學標志物，對于HBV血清學標志物中除乙型肝炎表面抗原外其余任何一項或一項以上陽性的新生兒采用FQ-PCR檢測其血清HBV-DNA的含量，并分析確診1例HBV感染病例的費用。 結果 血清HBV-DNA水平與HBV標志物表現模式有關，乙型肝炎e抗原（HBeAg）陽性的新生兒，FQ-PCR陽性率為3/16 （18.8%）。HBeAg陰性之新生兒，FQ-PCR陽性率為1/186（5.4‰）。HBeAg陽性病例為進一步明確乙型肝炎病毒含量而進行FQ-PCR檢測所產生的費用為587元/例，HBeAg陰性者為20 460元/例。 結論 FQ-PCR確診HBeAg陽性的新生兒為HBV感染的費用-效益比遠高于HBeAg陰性的新生兒，對于HBeAg陰性的新生兒該法不適合大規模的流行病學診斷性研究。