自新型冠狀病毒疫情暴發以來，全球已有 26 個國家受到影響，截止 2020 年 2 月 16 日，確診人數累計超過 6.8 萬，世界各國紛紛開展相關研究并發表論文。本文擬及時梳理研究信息，輔助不同崗位工作者在實踐或研究中的決策。用新型冠狀病毒肺炎（簡稱新冠肺炎）相關的中英文檢索詞在 Pubmed、Web of Science、CNKI、萬方數據庫、維普數據庫（VIP database）中進行檢索并補充相關專欄文獻，對納入研究的基本信息進行分布描述并對各研究主題的文獻進行梳理和總結。最終納入 301 篇文獻，自 1 月中旬論文發表呈上升趨勢，2 月 6 日單日發表達 50 篇；發表相關論文最多的國家及地區分別是中國內地、美國、英國等；Lancet 及其子刊發表文章數量最多，The New England Journal of Medicine（NEJM）、The Journal of the American Medical Association（JAMA）、Nature 等期刊也紛紛發表相關論文。本文就流行病學、臨床特征及診療、基礎研究、兒童孕婦、心理防護、疫情防控管理等研究方向對新冠肺炎相關研究進行了梳理和總結。
引用本文： 張龍浩, 李柏宏, 賈鵬, 蒲劍, 白蓓, 李音, 朱培嘉, 李雷, 曾國軍, 趙欣, 董珊珊, 劉夢菡, 張楠. 新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）全球研究現狀分析. 生物醫學工程學雜志, 2020, 37(2): 236-245. doi: 10.7507/1001-5515.202002034 復制
引言
2019 年 12 月，中國湖北省武漢市暴發新型冠狀病毒肺炎（簡稱新冠肺炎，Coronavirus Disease，COVID-19）疫情并迅速擴散至全國乃至世界 26 個國家和地區，截止 2020 年 2 月 16 日，全球累計確診病例超過 68 000 人[1]。2020 年 1 月 30 日該疫情被世界衛生組織（World Health Organization，WHO）認定為國際關注的突發公共衛生緊急事件（Public Health Emergency of International Concern，PHEIC）[2]，并于 2020 年 2 月 11 日正式命名為 COVID-19[3]。
此次疫情高度疑似于 2019 年 12 月初在武漢華南海鮮市場發生，且最初無法確定其病原[4]。隨著全球科研力量對疫情迅速反應，在短時間內確定其為一種新型冠狀病毒感染所致，并對這種新型冠狀病毒進行了全基因組測序，迅速開展各方面研究。以 The New England Journal of Medicine（NEJM）、Lancet、The Journal of the American Medical Association（JAMA）和 The BMJ 為代表的各大期刊紛紛開設新型冠狀病毒專題，開放綠色通道，加速同行評議，提前網絡發布，采取各種手段為新冠疫情相關科研情況的公開提供幫助[5-6]。1 月 30 日，Nature 雜志曾發布新聞，統計文獻發表情況，在短短一周的時間內就有近 30 篇文章發表[7]，內容包括病毒傳播的流行病學分析、病毒蛋白質結構和基因組成研究、臨床案例報告、治療方案/指南，為疫情控制和患者治療提供了寶貴信息。隨著研究的深入，更多研究獲得了進展，對疫情的認識更加清晰，也為戰勝疫情奠定了基礎。
本文擬采用文獻計量、聚類分類等方法，對現有新冠肺炎相關文獻數據進行分析，闡述研究的各類分布，梳理研究方向，并歸納總結研究熱點和前沿。隨后，通過對期刊影響力以及研究類型判斷選取優質文獻來構建各研究方向的學習列表，供戰“疫”期間不同崗位的醫務工作者和不同子領域的預防醫學研究人員快速查找當前最新的研究信息，并幫助其有選擇地使用不同置信度的結論。同時，在此基礎上，各領域工作者可快速跟進新的研究結果，持續加深對新冠肺炎的各研究前沿的了解和認識，從而更有效地輔助工作或研究中的決策，為快速遏制疫情做出貢獻。
1 方法
1.1 數據來源與檢索
數據庫：鑒于新冠肺炎疫情主要發生在中國，大部分研究來自于中國本土，數據庫選擇 PubMed 和 Web of Science（WOS）核心合集數據庫，以及 CNKI 中國知網、萬方數據庫、維普數據庫等中文數據庫，同時，對愛思唯爾（Elsevier）、科睿唯安（Clarivate Analytics）、中華醫學期刊網等新冠肺炎專欄進行查詢。采用 Endnote X8 進行文獻管理。
文獻檢索由兩名具有循證醫學背景和生物醫學背景的研究者獨立完成，完成后合并文獻并去重。英文檢索詞使用“novel coronavirus”“2019-Novel coronavirus infection”“2019-nCoV”“novel coronavirus pneumonia”“Novel coronavirus-infected pneumonia”；中文檢索詞使用“2019 新型冠狀病毒”“新型冠狀病毒感染”“新型冠狀病毒肺炎”“新冠肺炎”等；時間限定為 2019 年 12 月至 2020 年 2 月 10 日；后因文章發表增漲較快，我們于 2020 年 2 月 17 日再次進行補充檢索，新增檢索詞“COVID-19”“SARS-CoV-2”。納入類型為研究主題和目的與新冠肺炎有關的研究型文獻，并排除新聞報道、公眾號推文、通知、會議摘要、書籍、政府文件以及科普類文獻。［檢索策略見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 1。］
表1
檢索策略
Table1.
Information retrival strategy
1.2 數據提取與分析
使用 Endnote X8 管理文獻，通過人工查詢補充缺失信息（如發表時間、題目以及關鍵詞等），導出到 Excel 存儲數據，數據整理優化后導入特定制作的標準化 Access 信息提取表，兩名研究者獨立背對背進行數據提取。提取信息包括：納入文獻的作者、發表時間、題目、關鍵詞、摘要、期刊及期刊影響因子、國家/地區、作者機構和研究主題（流行病學、臨床特征及診療、基礎研究/基因組學/蛋白組學、兒童/孕婦防護、心理防護、疫情防控管理）等信息。
采用文獻計量學、統計描述等方法對研究基本要素的分布進行分析，并通過關鍵詞分析和摘要主題分析進一步歸納聚類和總結，闡述新冠肺炎相關研究的分布、前沿熱點及趨勢。使用文獻計量學方法，對研究的年份、期刊、國家/地區、研究主題的分布進行分析，通過統計描述和分布圖表展示各要素的占比和排序；基于對目前發表的國際國內研究背景和目的綜合分析，梳理主要研究方向，并歸納總結 COVID-19 相關的研究熱點和前沿。
1.3 構建文獻學習推薦列表
通過對納入文獻的研究方向進行分類，梳理各個研究主題近期發表的研究，并通過一定的排序原則（期刊影響力及研究類型）排序構建 COVID-19 各類主題學習列表。
2 結果
2.1 研究現狀
截止 2020 年 2 月 17 日，我們共檢索得到相關文獻 594 篇，去除重復文獻以及與新冠肺炎無關的文獻，并排除內容為新聞報道、科普推文、政府文件等非學術型文獻，最終納入共計 301 篇。其中英文文獻 165 篇，中文文獻 136；大學/學院發表 212 篇，醫院 175 篇，公共衛生機構 52 篇，學會/協會 26 篇；涉及臨床特征及診療信息的文獻 96 篇（含指南、共識、推薦等 43 篇）、基礎研究 50 篇、流行病學研究 71 篇，對疫情展開的綜述、述評等 61 篇。
2.1.1 時間分布
新冠肺炎相關文章自 2020 年 1 月中旬開始陸續發表，隨后發表數量呈線性增長趨勢，在短短不到一個月的時間里，共計發表 301 篇文章。其中 2 月 6 日和 2 月 13 日發表數量兩次達到高峰，單日發表量分別高達 50 和 36 篇（見圖 1）。1 月 15 日至 1 月 25 日期間發表的文獻大多為英文文獻，主要由中外合作或國外發表，大多關注疫情起源和發展，以及病毒的基因組結構；1 月 25 日至 1 月 31 日，開始有中文文獻發表，關注的研究主題增加了病毒傳播形式、疫情防護等；從 2 月 1 日開始，有關新冠肺炎確診病例分析以及診斷技術的文章開始增多，各地區、各場景、各人群的診療指南和防控方案也不斷涌現；2 月 10 日之后更多的文章關注新冠肺炎的診斷和治療以及疫情防控管理。但目前仍缺乏新冠肺炎針對性治療的研究性文章，有少量的中醫治療效果分析。
圖1
新冠肺炎相關研究發表數量時間趨勢
Figure1.
Time trend of the number of COVID-19 related research publications
2.1.2 國家及地區分布
已發表的 301 篇文獻中，共計有 36 個國家和地區參與，其中含國際/地區合作文章 59 篇。對文章數量貢獻最多的國家和地區分別是中國內地（217）、美國（42）、英國（22）、中國香港（18）、德國（12）、意大利（9）、韓國（8）、加拿大（7）和澳大利亞（7）等（見圖 2）。中國是新冠肺炎相關研究的主力，研究主題涵蓋新冠肺炎的流行病學史、基因組學、診斷、治療、公共衛生防護以及各類診療和防護指南等；國外發表的文章更多關注新冠肺炎的流行病學、診斷和治療以及基因組學。
圖2
新冠肺炎相關研究國家及地區發文貢獻
Figure2.
Contributions to COVID-19 related research publications by country and region
2.1.3 期刊分布
共計 147 家中外期刊發表過與新冠肺炎相關的文章，其中包括 NEJM、Lancet、JAMA、Nature、The BMJ 等頂級期刊（見圖 3）。其中發表數量最多的期刊為 Lancet，發表了 22 篇；發表中文文章最多的期刊是《中華結核和呼吸雜志》，數量為 11 篇。Lancet 及其子刊共計發表文章 26 篇，刊登的文章研究主題涵蓋新冠肺炎傳播途徑、流行病學特征、臨床特征、基因組學、大眾及醫務人員心理管理以及對疫情的點評、述評等[5, 8-23]；NEJM 發表的 8 篇文章則重點關注新冠肺炎的起源、流行病學特征以及疫情影響的評估等[4, 24-29]；JAMA 發表的 4 篇文章主要關注新冠肺炎的臨床特征以及此次疫情對醫生和公眾的影響[30-33]。影像學頂級期刊 Radiology 發表了 10 篇相關文章，更多關注新冠肺炎的診斷和影像學特征[34-39]。
圖3
新冠肺炎相關研究期刊發文貢獻
Figure3.
Contributions to COVID-19 related research publications by journal
2.2 研究主題及學習列表推薦
2.2.1 流行病學方向
納入的文獻中，有 71 篇關注了新冠肺炎的流行病學問題，這些研究致力于對疫情發生發展的準確反映，通過回顧病例數據進行統計，或基于已有數據建立模型進行預測，推測病毒的來源可能為蝙蝠冠狀病毒[40]，并確定傳播模式為人傳人[4, 41-42]。同時，對新冠病毒的基本流行病學特征進行了描述，例如感染人群數量、倍增時間、基本再生數、平均孵育時間等，并以此為基礎評估疫情現狀及走向，為疫情的防控決策及其他領域的研究提供信息支撐，是早期研究的主要方向。新冠肺炎疫情在中國暴發后迅速擴展至全球 26 個國家和地區，中國香港、美國、英國、日本、韓國等迅速開始關注和研究此次突發公共衛生事件。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 2。］
表2
新冠肺炎流行病學方向文獻學習列表
Table2.
Recommandation list of COVID-19 related research：Epidemiology
2.2.2 臨床特征及診療方向
納入的文獻中，有 96 篇關注了新冠肺炎的臨床特征和診療問題，文章類型主要包括指南、共識、推薦、策略、病例分析以及治療效果分析等，其中涉及臨床特征及治療的文章 35 篇，中醫治療相關文章 15 篇，診斷相關 18 篇。這類研究從確診病例的癥狀出發，對新冠肺炎的臨床表征進行詳細描述：常見癥狀包括發熱、疲勞和干咳；胸部計算機斷層掃描（computed tomography，CT）顯示，大部分患者的肺部都有雙側斑片狀陰影或毛玻璃樣渾濁[9, 18]；分享治療方案、藥物選擇：大多數患者接受抗病毒治療（奧司他韋），許多患者接受抗菌治療（莫西沙星、頭孢曲松、阿奇霉素）和糖皮質激素治療[18]。中醫治療列表的文章則從中醫角度出發，在癥狀描述的基礎上將新冠肺炎的中醫證型歸類為濕毒疫并給出治療方案[43-44]、推薦方藥劑量[44-46]和中成藥選擇[46]。Radiology 發表了多篇關于新冠肺炎臨床診斷的系列文章，關注肺炎患者的 CT 掃描的影像學特征描述及總結[34-37, 39, 47-49]，以及利用實時 RT-PCR 進行核酸檢測的方法[49]，并提示當臨床高度懷疑 SARS-CoV-2 感染但 RT-PCR 篩查為陰性時，重復拭子檢測和 CT 掃描相結合有助于新冠肺炎的臨床診斷。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 3。］
表3
新冠肺炎臨床特征與治療方向研究文獻學習列表
Table3.
Recommandation list of COVID-19 related research：Clinical diagnosis and treatments
2.2.3 基礎研究/基因組學/蛋白組學方向
納入的文獻中，有 50 篇關注了新冠肺炎的基礎研究/基因組學/蛋白組學等。這些研究遵循“中心法則”，首先對病毒基因組進行了全基因組測序和/或各冠狀病毒亞種間的基因組比對。部分研究對病毒關鍵蛋白序列進行了分析[14, 50-53]，有助于對病毒感染機制的認識和潛在治療方案的選擇，并為后續疫苗及藥物的研發奠定基礎。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 4。］
表4
新冠肺炎基礎研究/基因組學/蛋白組學方向文獻學習列表
Table4.
Recommandation list of COVID-19 related research：Basic research/genomic analysis/proteomic analysis
2.2.4 兒童/孕婦防護方向
納入的文獻中，有 12 篇關注了新冠肺炎的婦產兒童方向，文章類型大多為專家共識、推薦或建議等，涉及小兒新冠肺炎患者的診斷、治療和分級防控[54-60]，孕婦新冠肺炎患者的診斷和治療[61]，以及疫情期間母乳喂養應急管理[62]等。Schwartz 等[63]發文就 SARS-CoV-2 感染對母嬰的潛在影響進行了闡述，《中華兒科雜志》報道了上海首例兒童新冠肺炎確診病例[64]。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 5。］
表5
新冠肺炎兒童/孕婦防護方向文獻學習列表
Table5.
Recommandation list of COVID-19 related research：Pediatricology and obstetricology
2.2.5 心理防護方向
納入的文獻中，有 9 篇從疫情期間醫護人員及公眾心理健康入手，關注人群的心理健康問題。Lancet 發表北京大學醫學部評論[65]，強調新冠肺炎疫情期間應重視精神健康護理從而加強社會穩定；Lancet Psychiatry 則刊登了澳門大學健康科學學院[23]和武漢大學人民醫院[22]發表的文章，呼吁關注新冠肺炎疫情期間的心理衛生保健問題以及武漢市醫務人員的心理健康狀況。多家醫院和研究機構也開展了疫情期間針對醫護人員以及公眾的心理干預評估項目并提出心理應激防護等解決方案[66-70]。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 6。］
表6
新冠肺炎心理防護方向文獻學習列表
Table6.
Recommandation list of COVID-19 related research：Mental health
2.2.6 疫情防控管理模式方向
納入的文獻中，有 99 篇從各個方面的疫情防控管理入手，闡述了新冠肺炎快速傳播的應對、醫院感染及心理預防的加強、護理人力資源的加強、應急護理管理、院內防控資源推薦、社區防控管理以及門診管理等方面的問題。總結如下：① 從疫情防控的管理者角度要強調新冠肺炎是傳染病，不應漏掉病毒攜帶者、有癥狀的發病者和超級傳播者，以免造成社會危害。對于不能排除潛在接觸史的患者，有相關癥狀、影像表現為肺部感染以及白細胞不高的，即使核酸檢測陰性，也應該考慮為新冠肺炎疑似患者或者可疑病例，建議立即隔離并持續隨訪和觀察。在觀察過程中不應以度過 14 天隔離期或沒有癥狀為排除標準，重視在整個疫情期間的全程管理[69, 71]。② 新冠肺炎為乙類傳染病和檢疫傳染病，采取甲類傳染病的預防、控制措施和檢疫傳染病管理，公共衛生部門及社區應及時控制疫情播散和蔓延[72]。③ 醫院層面應重視護理人員的資源調配，充分發揮疫情期間護理資源的作用。同時組建多學科、多梯隊應急隊伍，重視培訓和人文關懷，進行科學有效的人力資源管理、門診管理、科室管理和藥學工作管理等[71, 73-78]。④ 醫院應重視醫院衛生以及病毒消殺工作，盡可能降低在醫院發生交叉感染的概率；作為最直接的前沿陣地，應該短時間內有序、有效、快速和安全地開展突發醫療救治工作[79]。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 7。］
表7
新冠肺炎疫情防控管理模式方向文獻學習列表
Table7.
Recommandation list of COVID-19 related research：Epidemic prevention and control
2.2.7 指南/共識/推薦/策略
納入的文獻中，有 43 篇為新冠肺炎診療和防控相關的指南、共識、推薦、策略及建議等。其中大部分由中國撰寫（41 篇），涉及新冠肺炎診斷和治療[46, 80-88]、婦幼兒童的診療及防護[54, 56, 58-61, 68]、疫情期間其他疾病的處理建議（如風濕免疫疾病[89]、急性主動脈夾層[90]、器官移植[91]、心肌梗死[92]等）、疫苗接種建議[93]以及門急診、手術室管理建議[71, 76, 94]等；1 篇由加拿大、英國發表，就新冠狀病毒（SARS-CoV-2）患者的重癥監護和麻醉團隊提出了實用性建議[95]；1 篇由阿根廷、巴西等國發表，提出疫情期間赴拉丁美洲旅游的旅行建議[96]。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 8。］
表8
新冠肺炎診療防控相關指南/共識/策略/建議相關文獻學習列表
Table8.
Recommandation list of COVID-19 related research：Guideline/concensus/strategy/suggestion
3 討論
新冠肺炎相關論文自 2020 年 1 月中旬開始陸續發表，在短短一個月的時間里，共計發表 301 篇論文，涵蓋疫情相關多個領域的研究，增進了人們對疫情的了解，為臨床應用、公共衛生防控和政策決策等提供了重要依據，充分展示了科學研究對疫情防控的重要意義。
國內外期刊紛紛做出努力，為研究信息的發表提供渠道，為研究信息的獲取掃除障礙。Lancet、NEJM、Cell 等國際頂級刊物紛紛推出新冠病毒信息中心，推出一系列措施促進研究信息及數據的及時分享[97]。同時，大量期刊、出版商在 Wellcome 信托發表申明承諾[98]：所有疫情相關的同行評議文章發表后（或一段時間內）免費開放；研究進展在投稿后作者同意的情況下隨時與世界衛生組織溝通；同行評議前就通過預印服務器發布論文內容；臨時/最終實驗數據最快最廣泛地在科研社群和世界衛生組織中分享；保證作者提前公布的數據不會影響最終發表。通過這一系列措施，打開了信息分享的渠道，使得知識能夠以最快的速度在科研社群里傳播，最終造福大眾。
但是值得注意的是，在研究結果涌現的背后，也存在著一些值得關注的問題。首先，研究者為了在短時間內發表文章，無法對論文進行反復細致的評估論證。同時，期刊為了快速發表文章，簡化、加快了同行評議，建立了發表的快速通道，一定程度上降低了同行評議的質量。這些論文的質量會在隨后接受更為嚴苛的論證，但在發表當時會對整個科學界對問題的認識產生一定影響。1 月 30 日，NEJM 刊登一篇題為“Transmision of 2019-nCoV Infection from an Asymptomatic Contact in Germany”的文章，報告一起無癥狀（asymptomatic）傳染他人的案例[27]。該論文作為首次揭露新冠病毒無癥狀感染的證據，影響了后續研究的認識。2 月 3 日下午，中國國家衛健委發布的《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案（試行第五版）》提到，“無癥狀感染者也可能成為傳染源”。但隨后 Science 雜志于 2 月 3 日刊登新聞稿件[99]，指出上述論文研究方法存在不合理之處，其研究人員在發表這篇論文之前并未真正和此位無癥狀感染者溝通，而僅僅依賴其余四位被感染者的描述。研究團隊于 2 月 5 日通過電話與無癥狀感染者進行了溝通，確認其在德國期間已有疲倦、肌肉疼痛并服用了退燒藥，并于次日向 NEJM 提交了補充材料[100]，詳細描述了溝通情況，但原文并未作修改。研究者希望盡快公開真相和想法，而雜志社希望能第一時間刊登重要結論，時間壓力可能使研究變得不嚴謹，影響論文的質量和可信度。
其次，大量文章在短時間內同時發表，會造成研究人員選題重復，使論文同質性增加。僅 2 月 6 日當天就發表了 50 篇論文，其中臨床方面 9 篇[101-109]，包含 4 篇影像學診斷[101, 103, 106-107]、2 篇指南共識[102, 105]、2 篇病例報告[104, 109]；綜述方面 8 篇[44, 110-116]，包含 5 篇中醫中藥治療方案[44, 112-115]；基礎方面 4 篇[52, 117-119]，包含 3 篇基因組分析研究[117-119]；流行病學方面 4 篇[41, 120-122]，3 篇對基本再生數 R0 進行了回顧/預測[41, 120, 122]。每篇文章都有各自的研究視角，提供了一種獨創的思考。但對讀者，特別是臨床工作者來說，造成了一定的信息負擔。
此外，預印版發表刊物的實驗設計合理性和必要性、數據分析方法的選擇以及研究結果的可靠性均有待評估。然而，全文結構完整并同時在高影響期刊在審中的預印版文章，其質量通常高于全文結構不完整的預印版文章。網絡平臺對預印版研究的快速傳播也會使得不同領域學者對非自己領域文獻的甄別難度加大，并且增加民眾對科學結果的誤解。這些都需要有影響力的官方機構進行及時、有效的澄清。
在疫情暴發的特殊時期，研究者們和期刊降低對論文質量的篩選程度，有助于產生更多知識，服務疫情防控。但上述問題的存在讓我們意識到，需要對信息進行甄別篩選。基于此，我們構建了推薦學習/參考文獻列表，希望通過對新冠肺炎主題相關研究的篩選分類及排序，讓用戶能夠更準確地找到需要的信息。這一模式對于特定領域的學習也有很大幫助，是一個有效的學科信息服務模式，在今后的工作中可以參考實施。
利益沖突聲明：本文全體作者均聲明不存在利益沖突。
引言
2019 年 12 月，中國湖北省武漢市暴發新型冠狀病毒肺炎（簡稱新冠肺炎，Coronavirus Disease，COVID-19）疫情并迅速擴散至全國乃至世界 26 個國家和地區，截止 2020 年 2 月 16 日，全球累計確診病例超過 68 000 人[1]。2020 年 1 月 30 日該疫情被世界衛生組織（World Health Organization，WHO）認定為國際關注的突發公共衛生緊急事件（Public Health Emergency of International Concern，PHEIC）[2]，并于 2020 年 2 月 11 日正式命名為 COVID-19[3]。
此次疫情高度疑似于 2019 年 12 月初在武漢華南海鮮市場發生，且最初無法確定其病原[4]。隨著全球科研力量對疫情迅速反應，在短時間內確定其為一種新型冠狀病毒感染所致，并對這種新型冠狀病毒進行了全基因組測序，迅速開展各方面研究。以 The New England Journal of Medicine（NEJM）、Lancet、The Journal of the American Medical Association（JAMA）和 The BMJ 為代表的各大期刊紛紛開設新型冠狀病毒專題，開放綠色通道，加速同行評議，提前網絡發布，采取各種手段為新冠疫情相關科研情況的公開提供幫助[5-6]。1 月 30 日，Nature 雜志曾發布新聞，統計文獻發表情況，在短短一周的時間內就有近 30 篇文章發表[7]，內容包括病毒傳播的流行病學分析、病毒蛋白質結構和基因組成研究、臨床案例報告、治療方案/指南，為疫情控制和患者治療提供了寶貴信息。隨著研究的深入，更多研究獲得了進展，對疫情的認識更加清晰，也為戰勝疫情奠定了基礎。
本文擬采用文獻計量、聚類分類等方法，對現有新冠肺炎相關文獻數據進行分析，闡述研究的各類分布，梳理研究方向，并歸納總結研究熱點和前沿。隨后，通過對期刊影響力以及研究類型判斷選取優質文獻來構建各研究方向的學習列表，供戰“疫”期間不同崗位的醫務工作者和不同子領域的預防醫學研究人員快速查找當前最新的研究信息，并幫助其有選擇地使用不同置信度的結論。同時，在此基礎上，各領域工作者可快速跟進新的研究結果，持續加深對新冠肺炎的各研究前沿的了解和認識，從而更有效地輔助工作或研究中的決策，為快速遏制疫情做出貢獻。
1 方法
1.1 數據來源與檢索
數據庫：鑒于新冠肺炎疫情主要發生在中國，大部分研究來自于中國本土，數據庫選擇 PubMed 和 Web of Science（WOS）核心合集數據庫，以及 CNKI 中國知網、萬方數據庫、維普數據庫等中文數據庫，同時，對愛思唯爾（Elsevier）、科睿唯安（Clarivate Analytics）、中華醫學期刊網等新冠肺炎專欄進行查詢。采用 Endnote X8 進行文獻管理。
文獻檢索由兩名具有循證醫學背景和生物醫學背景的研究者獨立完成，完成后合并文獻并去重。英文檢索詞使用“novel coronavirus”“2019-Novel coronavirus infection”“2019-nCoV”“novel coronavirus pneumonia”“Novel coronavirus-infected pneumonia”；中文檢索詞使用“2019 新型冠狀病毒”“新型冠狀病毒感染”“新型冠狀病毒肺炎”“新冠肺炎”等；時間限定為 2019 年 12 月至 2020 年 2 月 10 日；后因文章發表增漲較快，我們于 2020 年 2 月 17 日再次進行補充檢索，新增檢索詞“COVID-19”“SARS-CoV-2”。納入類型為研究主題和目的與新冠肺炎有關的研究型文獻，并排除新聞報道、公眾號推文、通知、會議摘要、書籍、政府文件以及科普類文獻。［檢索策略見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 1。］
表1
檢索策略
Table1.
Information retrival strategy
1.2 數據提取與分析
使用 Endnote X8 管理文獻，通過人工查詢補充缺失信息（如發表時間、題目以及關鍵詞等），導出到 Excel 存儲數據，數據整理優化后導入特定制作的標準化 Access 信息提取表，兩名研究者獨立背對背進行數據提取。提取信息包括：納入文獻的作者、發表時間、題目、關鍵詞、摘要、期刊及期刊影響因子、國家/地區、作者機構和研究主題（流行病學、臨床特征及診療、基礎研究/基因組學/蛋白組學、兒童/孕婦防護、心理防護、疫情防控管理）等信息。
采用文獻計量學、統計描述等方法對研究基本要素的分布進行分析，并通過關鍵詞分析和摘要主題分析進一步歸納聚類和總結，闡述新冠肺炎相關研究的分布、前沿熱點及趨勢。使用文獻計量學方法，對研究的年份、期刊、國家/地區、研究主題的分布進行分析，通過統計描述和分布圖表展示各要素的占比和排序；基于對目前發表的國際國內研究背景和目的綜合分析，梳理主要研究方向，并歸納總結 COVID-19 相關的研究熱點和前沿。
1.3 構建文獻學習推薦列表
通過對納入文獻的研究方向進行分類，梳理各個研究主題近期發表的研究，并通過一定的排序原則（期刊影響力及研究類型）排序構建 COVID-19 各類主題學習列表。
2 結果
2.1 研究現狀
截止 2020 年 2 月 17 日，我們共檢索得到相關文獻 594 篇，去除重復文獻以及與新冠肺炎無關的文獻，并排除內容為新聞報道、科普推文、政府文件等非學術型文獻，最終納入共計 301 篇。其中英文文獻 165 篇，中文文獻 136；大學/學院發表 212 篇，醫院 175 篇，公共衛生機構 52 篇，學會/協會 26 篇；涉及臨床特征及診療信息的文獻 96 篇（含指南、共識、推薦等 43 篇）、基礎研究 50 篇、流行病學研究 71 篇，對疫情展開的綜述、述評等 61 篇。
2.1.1 時間分布
新冠肺炎相關文章自 2020 年 1 月中旬開始陸續發表，隨后發表數量呈線性增長趨勢，在短短不到一個月的時間里，共計發表 301 篇文章。其中 2 月 6 日和 2 月 13 日發表數量兩次達到高峰，單日發表量分別高達 50 和 36 篇（見圖 1）。1 月 15 日至 1 月 25 日期間發表的文獻大多為英文文獻，主要由中外合作或國外發表，大多關注疫情起源和發展，以及病毒的基因組結構；1 月 25 日至 1 月 31 日，開始有中文文獻發表，關注的研究主題增加了病毒傳播形式、疫情防護等；從 2 月 1 日開始，有關新冠肺炎確診病例分析以及診斷技術的文章開始增多，各地區、各場景、各人群的診療指南和防控方案也不斷涌現；2 月 10 日之后更多的文章關注新冠肺炎的診斷和治療以及疫情防控管理。但目前仍缺乏新冠肺炎針對性治療的研究性文章，有少量的中醫治療效果分析。
圖1
新冠肺炎相關研究發表數量時間趨勢
Figure1.
Time trend of the number of COVID-19 related research publications
2.1.2 國家及地區分布
已發表的 301 篇文獻中，共計有 36 個國家和地區參與，其中含國際/地區合作文章 59 篇。對文章數量貢獻最多的國家和地區分別是中國內地（217）、美國（42）、英國（22）、中國香港（18）、德國（12）、意大利（9）、韓國（8）、加拿大（7）和澳大利亞（7）等（見圖 2）。中國是新冠肺炎相關研究的主力，研究主題涵蓋新冠肺炎的流行病學史、基因組學、診斷、治療、公共衛生防護以及各類診療和防護指南等；國外發表的文章更多關注新冠肺炎的流行病學、診斷和治療以及基因組學。
圖2
新冠肺炎相關研究國家及地區發文貢獻
Figure2.
Contributions to COVID-19 related research publications by country and region
2.1.3 期刊分布
共計 147 家中外期刊發表過與新冠肺炎相關的文章，其中包括 NEJM、Lancet、JAMA、Nature、The BMJ 等頂級期刊（見圖 3）。其中發表數量最多的期刊為 Lancet，發表了 22 篇；發表中文文章最多的期刊是《中華結核和呼吸雜志》，數量為 11 篇。Lancet 及其子刊共計發表文章 26 篇，刊登的文章研究主題涵蓋新冠肺炎傳播途徑、流行病學特征、臨床特征、基因組學、大眾及醫務人員心理管理以及對疫情的點評、述評等[5, 8-23]；NEJM 發表的 8 篇文章則重點關注新冠肺炎的起源、流行病學特征以及疫情影響的評估等[4, 24-29]；JAMA 發表的 4 篇文章主要關注新冠肺炎的臨床特征以及此次疫情對醫生和公眾的影響[30-33]。影像學頂級期刊 Radiology 發表了 10 篇相關文章，更多關注新冠肺炎的診斷和影像學特征[34-39]。
圖3
新冠肺炎相關研究期刊發文貢獻
Figure3.
Contributions to COVID-19 related research publications by journal
2.2 研究主題及學習列表推薦
2.2.1 流行病學方向
納入的文獻中，有 71 篇關注了新冠肺炎的流行病學問題，這些研究致力于對疫情發生發展的準確反映，通過回顧病例數據進行統計，或基于已有數據建立模型進行預測，推測病毒的來源可能為蝙蝠冠狀病毒[40]，并確定傳播模式為人傳人[4, 41-42]。同時，對新冠病毒的基本流行病學特征進行了描述，例如感染人群數量、倍增時間、基本再生數、平均孵育時間等，并以此為基礎評估疫情現狀及走向，為疫情的防控決策及其他領域的研究提供信息支撐，是早期研究的主要方向。新冠肺炎疫情在中國暴發后迅速擴展至全球 26 個國家和地區，中國香港、美國、英國、日本、韓國等迅速開始關注和研究此次突發公共衛生事件。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 2。］
表2
新冠肺炎流行病學方向文獻學習列表
Table2.
Recommandation list of COVID-19 related research：Epidemiology
2.2.2 臨床特征及診療方向
納入的文獻中，有 96 篇關注了新冠肺炎的臨床特征和診療問題，文章類型主要包括指南、共識、推薦、策略、病例分析以及治療效果分析等，其中涉及臨床特征及治療的文章 35 篇，中醫治療相關文章 15 篇，診斷相關 18 篇。這類研究從確診病例的癥狀出發，對新冠肺炎的臨床表征進行詳細描述：常見癥狀包括發熱、疲勞和干咳；胸部計算機斷層掃描（computed tomography，CT）顯示，大部分患者的肺部都有雙側斑片狀陰影或毛玻璃樣渾濁[9, 18]；分享治療方案、藥物選擇：大多數患者接受抗病毒治療（奧司他韋），許多患者接受抗菌治療（莫西沙星、頭孢曲松、阿奇霉素）和糖皮質激素治療[18]。中醫治療列表的文章則從中醫角度出發，在癥狀描述的基礎上將新冠肺炎的中醫證型歸類為濕毒疫并給出治療方案[43-44]、推薦方藥劑量[44-46]和中成藥選擇[46]。Radiology 發表了多篇關于新冠肺炎臨床診斷的系列文章，關注肺炎患者的 CT 掃描的影像學特征描述及總結[34-37, 39, 47-49]，以及利用實時 RT-PCR 進行核酸檢測的方法[49]，并提示當臨床高度懷疑 SARS-CoV-2 感染但 RT-PCR 篩查為陰性時，重復拭子檢測和 CT 掃描相結合有助于新冠肺炎的臨床診斷。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 3。］
表3
新冠肺炎臨床特征與治療方向研究文獻學習列表
Table3.
Recommandation list of COVID-19 related research：Clinical diagnosis and treatments
2.2.3 基礎研究/基因組學/蛋白組學方向
納入的文獻中，有 50 篇關注了新冠肺炎的基礎研究/基因組學/蛋白組學等。這些研究遵循“中心法則”，首先對病毒基因組進行了全基因組測序和/或各冠狀病毒亞種間的基因組比對。部分研究對病毒關鍵蛋白序列進行了分析[14, 50-53]，有助于對病毒感染機制的認識和潛在治療方案的選擇，并為后續疫苗及藥物的研發奠定基礎。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 4。］
表4
新冠肺炎基礎研究/基因組學/蛋白組學方向文獻學習列表
Table4.
Recommandation list of COVID-19 related research：Basic research/genomic analysis/proteomic analysis
2.2.4 兒童/孕婦防護方向
納入的文獻中，有 12 篇關注了新冠肺炎的婦產兒童方向，文章類型大多為專家共識、推薦或建議等，涉及小兒新冠肺炎患者的診斷、治療和分級防控[54-60]，孕婦新冠肺炎患者的診斷和治療[61]，以及疫情期間母乳喂養應急管理[62]等。Schwartz 等[63]發文就 SARS-CoV-2 感染對母嬰的潛在影響進行了闡述，《中華兒科雜志》報道了上海首例兒童新冠肺炎確診病例[64]。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 5。］
表5
新冠肺炎兒童/孕婦防護方向文獻學習列表
Table5.
Recommandation list of COVID-19 related research：Pediatricology and obstetricology
2.2.5 心理防護方向
納入的文獻中，有 9 篇從疫情期間醫護人員及公眾心理健康入手，關注人群的心理健康問題。Lancet 發表北京大學醫學部評論[65]，強調新冠肺炎疫情期間應重視精神健康護理從而加強社會穩定；Lancet Psychiatry 則刊登了澳門大學健康科學學院[23]和武漢大學人民醫院[22]發表的文章，呼吁關注新冠肺炎疫情期間的心理衛生保健問題以及武漢市醫務人員的心理健康狀況。多家醫院和研究機構也開展了疫情期間針對醫護人員以及公眾的心理干預評估項目并提出心理應激防護等解決方案[66-70]。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 6。］
表6
新冠肺炎心理防護方向文獻學習列表
Table6.
Recommandation list of COVID-19 related research：Mental health
2.2.6 疫情防控管理模式方向
納入的文獻中，有 99 篇從各個方面的疫情防控管理入手，闡述了新冠肺炎快速傳播的應對、醫院感染及心理預防的加強、護理人力資源的加強、應急護理管理、院內防控資源推薦、社區防控管理以及門診管理等方面的問題。總結如下：① 從疫情防控的管理者角度要強調新冠肺炎是傳染病，不應漏掉病毒攜帶者、有癥狀的發病者和超級傳播者，以免造成社會危害。對于不能排除潛在接觸史的患者，有相關癥狀、影像表現為肺部感染以及白細胞不高的，即使核酸檢測陰性，也應該考慮為新冠肺炎疑似患者或者可疑病例，建議立即隔離并持續隨訪和觀察。在觀察過程中不應以度過 14 天隔離期或沒有癥狀為排除標準，重視在整個疫情期間的全程管理[69, 71]。② 新冠肺炎為乙類傳染病和檢疫傳染病，采取甲類傳染病的預防、控制措施和檢疫傳染病管理，公共衛生部門及社區應及時控制疫情播散和蔓延[72]。③ 醫院層面應重視護理人員的資源調配，充分發揮疫情期間護理資源的作用。同時組建多學科、多梯隊應急隊伍，重視培訓和人文關懷，進行科學有效的人力資源管理、門診管理、科室管理和藥學工作管理等[71, 73-78]。④ 醫院應重視醫院衛生以及病毒消殺工作，盡可能降低在醫院發生交叉感染的概率；作為最直接的前沿陣地，應該短時間內有序、有效、快速和安全地開展突發醫療救治工作[79]。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 7。］
表7
新冠肺炎疫情防控管理模式方向文獻學習列表
Table7.
Recommandation list of COVID-19 related research：Epidemic prevention and control
2.2.7 指南/共識/推薦/策略
納入的文獻中，有 43 篇為新冠肺炎診療和防控相關的指南、共識、推薦、策略及建議等。其中大部分由中國撰寫（41 篇），涉及新冠肺炎診斷和治療[46, 80-88]、婦幼兒童的診療及防護[54, 56, 58-61, 68]、疫情期間其他疾病的處理建議（如風濕免疫疾病[89]、急性主動脈夾層[90]、器官移植[91]、心肌梗死[92]等）、疫苗接種建議[93]以及門急診、手術室管理建議[71, 76, 94]等；1 篇由加拿大、英國發表，就新冠狀病毒（SARS-CoV-2）患者的重癥監護和麻醉團隊提出了實用性建議[95]；1 篇由阿根廷、巴西等國發表，提出疫情期間赴拉丁美洲旅游的旅行建議[96]。［相關推薦的文獻學習列表見 http://www.kangpa.org/article/10.7507/1001-5515.202002034 附表 8。］
表8
新冠肺炎診療防控相關指南/共識/策略/建議相關文獻學習列表
Table8.
Recommandation list of COVID-19 related research：Guideline/concensus/strategy/suggestion
3 討論
新冠肺炎相關論文自 2020 年 1 月中旬開始陸續發表，在短短一個月的時間里，共計發表 301 篇論文，涵蓋疫情相關多個領域的研究，增進了人們對疫情的了解，為臨床應用、公共衛生防控和政策決策等提供了重要依據，充分展示了科學研究對疫情防控的重要意義。
國內外期刊紛紛做出努力，為研究信息的發表提供渠道，為研究信息的獲取掃除障礙。Lancet、NEJM、Cell 等國際頂級刊物紛紛推出新冠病毒信息中心，推出一系列措施促進研究信息及數據的及時分享[97]。同時，大量期刊、出版商在 Wellcome 信托發表申明承諾[98]：所有疫情相關的同行評議文章發表后（或一段時間內）免費開放；研究進展在投稿后作者同意的情況下隨時與世界衛生組織溝通；同行評議前就通過預印服務器發布論文內容；臨時/最終實驗數據最快最廣泛地在科研社群和世界衛生組織中分享；保證作者提前公布的數據不會影響最終發表。通過這一系列措施，打開了信息分享的渠道，使得知識能夠以最快的速度在科研社群里傳播，最終造福大眾。
但是值得注意的是，在研究結果涌現的背后，也存在著一些值得關注的問題。首先，研究者為了在短時間內發表文章，無法對論文進行反復細致的評估論證。同時，期刊為了快速發表文章，簡化、加快了同行評議，建立了發表的快速通道，一定程度上降低了同行評議的質量。這些論文的質量會在隨后接受更為嚴苛的論證，但在發表當時會對整個科學界對問題的認識產生一定影響。1 月 30 日，NEJM 刊登一篇題為“Transmision of 2019-nCoV Infection from an Asymptomatic Contact in Germany”的文章，報告一起無癥狀（asymptomatic）傳染他人的案例[27]。該論文作為首次揭露新冠病毒無癥狀感染的證據，影響了后續研究的認識。2 月 3 日下午，中國國家衛健委發布的《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案（試行第五版）》提到，“無癥狀感染者也可能成為傳染源”。但隨后 Science 雜志于 2 月 3 日刊登新聞稿件[99]，指出上述論文研究方法存在不合理之處，其研究人員在發表這篇論文之前并未真正和此位無癥狀感染者溝通，而僅僅依賴其余四位被感染者的描述。研究團隊于 2 月 5 日通過電話與無癥狀感染者進行了溝通，確認其在德國期間已有疲倦、肌肉疼痛并服用了退燒藥，并于次日向 NEJM 提交了補充材料[100]，詳細描述了溝通情況，但原文并未作修改。研究者希望盡快公開真相和想法，而雜志社希望能第一時間刊登重要結論，時間壓力可能使研究變得不嚴謹，影響論文的質量和可信度。
其次，大量文章在短時間內同時發表，會造成研究人員選題重復，使論文同質性增加。僅 2 月 6 日當天就發表了 50 篇論文，其中臨床方面 9 篇[101-109]，包含 4 篇影像學診斷[101, 103, 106-107]、2 篇指南共識[102, 105]、2 篇病例報告[104, 109]；綜述方面 8 篇[44, 110-116]，包含 5 篇中醫中藥治療方案[44, 112-115]；基礎方面 4 篇[52, 117-119]，包含 3 篇基因組分析研究[117-119]；流行病學方面 4 篇[41, 120-122]，3 篇對基本再生數 R0 進行了回顧/預測[41, 120, 122]。每篇文章都有各自的研究視角，提供了一種獨創的思考。但對讀者，特別是臨床工作者來說，造成了一定的信息負擔。
此外，預印版發表刊物的實驗設計合理性和必要性、數據分析方法的選擇以及研究結果的可靠性均有待評估。然而，全文結構完整并同時在高影響期刊在審中的預印版文章，其質量通常高于全文結構不完整的預印版文章。網絡平臺對預印版研究的快速傳播也會使得不同領域學者對非自己領域文獻的甄別難度加大，并且增加民眾對科學結果的誤解。這些都需要有影響力的官方機構進行及時、有效的澄清。
在疫情暴發的特殊時期，研究者們和期刊降低對論文質量的篩選程度，有助于產生更多知識，服務疫情防控。但上述問題的存在讓我們意識到，需要對信息進行甄別篩選。基于此，我們構建了推薦學習/參考文獻列表，希望通過對新冠肺炎主題相關研究的篩選分類及排序，讓用戶能夠更準確地找到需要的信息。這一模式對于特定領域的學習也有很大幫助，是一個有效的學科信息服務模式，在今后的工作中可以參考實施。
利益沖突聲明：本文全體作者均聲明不存在利益沖突。
